Мирное соглашение было подписано в Маркуси (Франция) 26 января 2003 года, Гбагбо сохранил президентский пост, повстанцы вошли в правительство национального примирения. Официальное окончание гражданской войны было объявлено 4 июля 2003 года, после подписания между правительством и «Новыми силами» соответствующей декларации.
Однако ситуация оставалась спокойной недолго. Повстанцы обвиняли Лорана Гбагбо в попытке узурпации власти, он, в свою очередь, начал закрывать оппозиционные органы СМИ. При этом стороны усиленно вооружались. 13 октября 2004 года руководство «Новых сил» объявило о выходе из процесса разоружения, поскольку боевики перехватили в районе демаркационной линии два грузовика с оружием, предназначенных для ивуарийской армии. 28 октября на северных территориях, контролируемых повстанцами, было объявлено чрезвычайное положение.
То, что произошло дальше, так и не получило рационального объяснения президента Гбагбо. 4 ноября он приказал нанести авиаудары по позициям повстанцев, бомбардировке была подвергнута их столица Буаке. Но 6 ноября, по крайней мере, один (по другим данным, два) штурмовик Су-25 атаковал французскую базу в Буаке, где были расквартированы части 2-го и танкового полков морской пехоты, 505-го транспортного полка. Погибли 9 французских военнослужащих, 37 были ранены.
Все что мог сказать затем президент Гбагбо, «это была ошибка». Это выглядит несколько неубедительно на фоне того, что вскоре несколько сотен его сторонников по призыву государственной радиостанции начали грабить в Абиджане европейские офисы и дома. Несколько сот европейцев спасались от разъяренной толпы на крышах своих домов, их пришлось вывозить французскими вертолетами. ВВС Франции и Испании эвакуировали из страны 2,6 тысячи европейских экспатриантов (1,6 тысячи французов).
Французы же, конечно, не простили «этой ошибки», и через несколько часов самолеты ВВС Франции уничтожили на аэродроме в Ямусукро всю ивуарийскую военную авиацию — два Су-25 и три ударных вертолета. Еще два военно-транспортных вертолета французы сбили в небе над Абиджаном. В дополнение к ивуарийской была усилена на 600 человек французская группировка в Габоне. Но дальнейшего продолжения франко-ивуарийский конфликт не имел.
Усилиями Африканского союза между враждующими сторонами 4 марта 2007 года было достигнуто мирное соглашение. Гбагбо остался на своем посту, лидер «Новых сил» Гуильям Соро стал премьер-министром, демаркационная линия была ликвидирована. Президентские выборы запланировали на конец июня 2008 года, но в итоге их отложили до октября 2010 года.
