После неудачной попытки сбить самолет Каддафи противостояние в Чаде разгорелось с новой силой. В июне 1983-го объединенные вооруженные силы Уэддея и Ливии начали мощное наступление на севере страны. Под ударами танков и МИГов Хабре отступал и терял один ключевой город за другим. В ответ Франция перебросила из соседней Центральной Африканской Республики войска, включая вертолеты для уничтожения бронетехники и истребители-бомбардировщики. Наступление удалось остановить, к январю 83-го в Чаде установилось хрупкое равновесие.
В январе попытку продолжить наступление с севера французы пресекли авиаударами двух боевых самолетов. Практически признав разделение страны на две части, Франция договорилась с Ливией о выводе войск к 10 ноября 1984 года.
Франция выполнила свою часть договора, но Каддафи не поспешил последовать ее примеру и оставил в Чаде около трех тысяч военнослужащих. В феврале 1986 ливийские танки пересекли условную линию перемирия и атаковали укрепленный пункт Куба-Оланга. Полковник планировал путем слияния Ливии с Чадом значительно расширить народное арабское государство. Уэддей в этом не собирался участвовать и перешел на сторону своего бывшего противника Хабре.
Сплотившиеся против Каддафи чадские группировки оказывали активное сопротивление армии Джамахирии. Конфликт длился до конца 1987 года. Ливийские войска имели возможность оказать решающую поддержку в гражданской войне, но захватить, а главное, удержать власть в стране не могли.
Бомбежки американцами Триполи в 1986-м тоже сыграли свою роль. Франция вернулась в Чад и активно, огневой поддержкой с воздуха, помогала выбивать воинов Джамахирии из страны. Войска Каддафи под командованием генерала Халифа Хафтара удерживали только несколько отдельных районов на севере. Когда же французы снабдили отряды дружественных африканцев четырьмя сотнями внедорожников «тойота», на которых установили легкие противотанковые ракеты «Милан» или крупнокалиберные пулеметы, ливийцам пришлось уйти из страны. Боевой генерал Халиф Хафтар испугался гнева Каддафи за проигранную войну и удрал в США. Ливийским спецслужбам был отдан приказ на его устранение.
В сентябре 1989-го взрыв пассажирского самолета французской авиакомпании UTA над территорией Нигера унес жизни 170-ти человек. Французская полевая жандармерия нашла в Африке следы бомбы, заложенной в самолет: взрывчатку чехословацкого производства и специальные взрыватели. Парижская пресса назвала этот теракт местью полковника Каддафи за поражение в Чаде. Судя по материалам, руководил терактом соратник полковника еще по свержению короля генерал Юнис. Этого руководителя одной из спецслужб Ливии, выполнявшую личные распоряжения Муаммара Каддафи, и боялся больше всего на свете Халиф Хафтар.
