На следующем этапе развития религиозных представлений, когда эпоха древних охотников сменилась периодом земледелия и скотоводства, обозначилась зависимость человека от различных природных стихий, поэтому ведущая роль в пантеоне богов стала принадлежать божествам, олицетворявшим данные стихии: Ра (солнце), Нут (небо), Тот (луна), Геб (земля). Появилось также божество Хапи, олицетворяющее реку Нил, которого особенно почитали земледельцы Египта. Каждый округ государства (ном) почитал своего главного бога. Так, в Фивах поклонялись Амону, а в Гелиополе – Ра-Атуму.
В Гелиополе существовала своя версия мироздания, творцом которой признавался Ра, отождествленный с Атумом («совершенный») и Хепри («тот, кто возникает»). Атум существовал в образе человека, а Хепри – в виде жука-скарабея. Хепри воспринимался египтянами как Атум (заходящее солнце) и Ра (дневное светило). Благодаря способности жука размножаться и способу передвижения, при котором он двигал впереди себя свой шар, его наделяли божественной созидательной силой и создали образ бога, перемещавшего солнце по небу. Миф, приписывающий создание мира Атуму, Ра и Хепри, содержится в «Текстах пирамид», но он был известен задолго до того момента, когда его запечатлели в камне.
Жрецы Мемфиса, другого крупного религиозного и политического центра Египта, создали мифы о многочисленных богах, но всех их подчинили богу Пта как родоначальнику мироздания. Примечательно, что в мемфисских мифах они не рождаются от своих родителей, а появляются в результате усилий слова и мысли. Затем сложились так называемые божественные триады, когда почитали одновременно трех кровно связанных богов: главный бог (бог солнца), его жена (богиня неба) и их сын (бог луны) – Амон-Мут-Хонсу. Вокруг них строилась иерархическая система богов.
Объединение Верхнего и Нижнего Египта и появление деспотии вызвало необходимость в создании общегосударственных культов. Тогда на лидирующие позиции выдвинулись божества городов-гегемонов. Когда столицей Египта стали Фивы (эпоха Среднего и Нового царств), верховным богом был провозглашен Амон, которого жрецы уравняли с богом Ра.
В иерархии божеств с верховным богом во главе отразилась структура общественного строя. Царь богов Амон-Ра (Ра-Атум) возглавлял двор и имел визиря (бог Тот) и собственные канцелярии. Государственная религия отождествляла фараона с богом, сделала его живым воплощением царя богов и требовала воздавать ему соответствующие почести.
