Предложение фон Барзевиша удалось реализовать лишь в малой степени. В июле 1944 года Do 335V3, оснащенный камерой Rb 50/18 передали на испытания в экспериментальную часть 1./Versuchsverband OKL. Основываясь на накопленном опыте, была разработана разведывательная модификация самолета, получившая обозначение Do 335A-4. На разведчик планировалось установить две камеры Rb 50/18 или 50/30, установленные в бомбоотсеке. Предполагалось, что самолет не будет нести вооружения, а его защитой будет большая скорость. А-4 мог брать на внешнюю подвеску дополнительные топливные баки, увеличивавшие дальность полета. Вероятно, на самолете должны были стоять моторы DB 603G. Все говорит за то, что до конца войны ни одного разведчика не построили (в некоторых источниках упоминается о двух-трех построенных самолетах).
О модификации Do 335A-5 можно сказать еще меньше. Очевидно, это был истребитель, оснащенный двигателями Jumo 213. Такие же двигатели предполагалось установить на бомбардировщике А-7, тяжелом истребителе А-8 и разведчике А-9. Тут следует упомянуть о чертеже, составленном на фирме Junkers и датированным 7 декабря 1944 года. На чертеже изображен разрез фюзеляжа с установленными в бомбоотсеке двумя фотокамерами Rb 50/30. Там же находился 250-литровый бак с закисью азота для устройства GM-1. Вероятно, этот чертеж относился к Do 335А-9.
Одновременно с развитием модификаций А-0 и А-1 шли работы над двухместной учебной версией самолета. Необычная схема самолета и его необычные характеристики требовали дополнительной подготовки пилотов. Учебные самолеты, базирующиеся на истребительной модификации, позволяли проводить подготовку летчиков под надзором инструктора. Учебных модификаций было три: Do 335A-10 с двигателями Jumo 213 (не было изготовлено ни одной такой машины), Do 335А-11 на базе А-0 и Do 335A-12 на базе А-1. На учебных самолетах имелась вторая кабина, расположенная за главной кабиной, образуя характерный горб. Во второй кабине имелся набор основных приборов и органов управления. Кресло инструктора, в отличие от кресла курсанта, не было оборудовано катапультой. На учебном самолете уменьшили объем бензобаков, а также сняли вооружение. Самолету присвоили собственное название «Ameisenbaer» (муравьед).
11 октября 1944 года флюгкапитан Аппель совершил первый полет на двухместной машине Do 335M11 (CP+UL, W.Nr. 230011) — прототипе А-11. Самолет создали на базе планера А-0, оснастив его двигателями DB 603А-2. Такие двигатели должны были стоять на серийных А-11. Вскоре в воздух поднялся М12 (RP+UO, W.Nr. 230012), второй прототип А-11. Do 335M11, испытывавшийся в Менгене, повредил при посадке шасси. Одновременно с летными испытаниями, на этом прототипе отрабатывался механизм аварийного сброса заднего винта. Do 335M12, в свою очередь, оснащался винтами Messerschmitt P8 с возможностью реверса. Этот самолет позднее был уничтожен во Фридрихсхафене, чтобы он не попал в руки наступающих союзников. Следует отметить, что после того, как прототип МП получил повреждения и был списан, появился второй самолет с таким же обозначением. Этот новый МП имел серийный номер W.Nr. 240318. Вероятно это был одноместный самолет Do 335В, однако его не закончили.
