Фактическая ликвидация вассального мамлюкского королевства вызвала возмущение среди мамлюков и бедуинов. Восстание возглавил Джаним ас-Сайфи, но оно было быстро подавлено местными османскими войсками, которые обошлись без присылки подкреплений. Джаним ас-Сайфи погиб в бою.
После подавления восстания наместником Египта султан назначил Ахмеда-пашу, грузина по национальности, одного из победителей родосских рыцарей. Тот надеялся, что за заслуги его назначат на пост великого визиря, но Сулейман Великолепный предпочел ему своего фаворита Ибрагима-пашу, а Ахмеда-пашу отправил в Египет. Тот воспринял это назначение как почетную ссылку. В декабре 1523 года Ахмед-паша прибыл в Каир, где быстро нашел общий язык с бедуинскими шейхами и мамлюками. Узнав об этом, Сулейман Великолепный отправил в Египет гонца с секретным приказанием убить Ахмеда-пашу. Но гонец был перехвачен мамлюками, и Ахмед-паша, решив, что ему терять больше нечего, поднял мятеж. На его сторону встали большинство мамлюков и бедуинов.
В январе 1524 года в Каир вошли ополчения бедуинских эмиров Ахмеда ибн Бакра из Шаркии и Ибн Омара из Саида (Верхний Египет). Опираясь на их поддержку, Ахмед-паша объявил себя султаном Египта, заявил об отделении от Оттоманской империи и восстановлении мамлюкского государства в Египте и Сирии.
Он сместил всех османских чиновников, казнил янычарских офицеров и начал формирование мамлюкской армии. Однако 23 февраля 1524 года жители Каира, в свою очередь, взбунтовались и свергли Ахмеда-пашу. Тот в момент восстания находился в бане, откуда сумел бежать, но вскоре был схвачен и 6 марта казнен.
Узнав о мятеже Ахмеда-паши, Сулейман Великолепный отправил в Каир Ибрагима-пашу. Тот прибыл в Египет 24 марта 1524 года. Ибрагим казнил мятежных бедуинских шейхов и окончательно расформировал войско мамлюков.
Султан решил три года не воевать, чтобы заняться внутренним обустройством государства и повышением боеспособности армии. Но очень скоро выяснилось, что армию опасно долго оставлять без дела. В мирное время, изнывая от бездействия, больше не живя в обстановке жесткой дисциплины, а пребывая в относительной праздности, янычары представляли немалую опасность для своего повелителя.
Весной 1525 года в Стамбуле вспыхнул мятеж янычар, который султан жестоко подавил, казнив значительную часть офицеров. Были казнены ага янычар и зачинщики мятежа. Присмиревшие янычары вернулись в казармы. Вот как писал об этих молодых воинах венецианец Бенедетто Рамберти, секретарь Венецианской республики, в 1534 году путешествовавший по маршруту Венеция – Рагуза (Дубровник) – Ниш – София – Адрианополь (Эдирне) – Селимврия – Константинополь (Стамбул): «Янычар насчитывается около двенадцати тысяч человек, и каждый из них получает от трех до восьми серебряных асперсов в день. Раз в году им выдают голубую ткань неважного качества для пошива формы. Живут янычары в Константинополе в двух казармах. Когда они выступают в поход, по сто солдат отряжается на переноску снаряжения для шатра, по три солдата ведут коня с полной сбруей. Когда янычары стареют или попадают в немилость к султану, их имена вычеркиваются из списков гвардии и они отсылаются на охрану крепостей. Это отстранение от службы не влечет за собой обнищания, те же, кто отличился на войне, получают посты глав местной администрации.
