В 1903 г. почетные граждане братья Н.К. и И. К. Синягины пожертвовали Институту экспериментальной медицины 100 тысяч рублей на учреждение клиники «как для бесплатного пользования неимущих больных кожными и венерическими болезнями, так и для научно-экспериментального изучения этих болезней». По проекту гражданского инженера С. А. Баранкеева к маю 1906 г. возведено трехэтажное здание больницы имени В. К. Синягина и А. К. Чекалевой — брата и сестры жертвователей (дом № 9). К проектированию для консультации привлекался доктор А. Н. Соловьев, занимавшийся изучением кожных заболеваний. Он же (с 6 ноября 1906 г.) стал первым директором этой клиники. Она стала Вторым Практическим отделением ИЭМ. На фасадах здания кирпичная кладка сочетается с оштукатуренными частями, окна второго и третьего этажей обрамлены наличниками с замковыми камнями. Здание увенчано шлемовидным куполом.
7 октября 1904 г. на четвертом этаже больницы заложили церковь мученицы царицы Александры на 125 молящихся. Освящение ее состоялось 21 декабря 1906 г. в присутствии принца А. П. Ольденбургского, директора ИЭМ В. В. Подвысоцкого. Пели в храме слепые из Александро-Мариинского училища (см.: ул. Профессора Попова, 37).
При освящении террорист, бывший член тамбовского комитета партии эсер Евгений Кудрявцев по кличке Адмирал тремя выстрелами на лестнице убил градоначальника генерал-майора В.Ф. фон-дер Лауница и сразу же застрелился на месте покушения.
В 1913 г. в больнице открыли бюст Н. К. Синягина работы скульптора Ю. Н. Свирской. С 26 августа 1914 г., с началом Первой мировой войны, в больнице размещался лазарет на двести человек, хотя в мирное время на стационарном лечении в ней находилось не более 65 человек.
В Первую мировую войну многие сотрудники ИЭМ уходили врачами в госпитали, лазареты, в санитарные поезда.
В конце 1917 г. церковь закрыли и через шесть лет ликвидировали.
С 1938 по 1970 г. здесь находился НИИ вакцин и сывороток АМН СССР. В настоящее время — клиника невралгического и нейрохирургического профиля. В 1920–1964 гг. в ней работал крупнейший патоморфолог академик Н. Н. Аничков. В 1968 г. в память об этом по проекту скульптора Е. А. Васильева установлена мемориальная доска. В клинике имелись жилые комнаты, в одной из них проживал профессор сектора эпидемиологии П. Ф. Здродовский.
В 1977 г., после капитального ремонта корпуса бывшего Второго практического отделения в нем открыли клинику Института, затем построили еще два корпуса. В 1990 г. клиника и Отдел нейрофизиологии человека вошли в состав Института мозга человека РАН.
