Мероприятия в области таможенного законодательства были подкреплены соответствующими мерами, направленными на усиление таможенной охраны в целях предотвращения контрабандного ввоза и вывоза товаров. Для этих целей в Москве существовали большая таможня, посольская новая таможня, мытная изба и др., решавшие вопросы обложения пошлинами провозимых товаров. В уездах действовали таможенные избы, в которых служили первостатейные купцы, на торговых путях имелись таможенные заставы. С помощью подьячих провозимые товары облагались пошлинами, о чем велись записи в таможенных книгах. Таможенники подчинялись только центральной власти, и местные воеводы были не вправе вмешиваться в их деятельность.
Таможенное обложение расширявшейся торговли стало важным источником доходов государственной казны. Хотя в условиях слабости финансового аппарата в России правительство, как и в ряде стран Западной Европы в период первоначального накопления капитала, отдавало взимание таможенных пошлин на откуп купцам и крупным помещикам, оно усилило контроль за сбором таможенных пошлин. Был установлен строгий контроль за соблюдением закона, запрещавшего ввоз и продажу на внутреннем рынке некоторых видов товаров, на которые существовал либо запрет потреблять их, например табак, либо была установлена государственная монополия — спиртные напитки.
Соборным уложением 1649 года были определены составы различных преступлений. Так, в нем предусматривались преступления против порядка управления, к которым относилось, в частности, кормчество, под которым понималось незаконное производство, контрабандный ввоз и продажа спиртных напитков и других товаров, составляющих государственную монополию.
Преобладающей мерой наказания в XVII—XVIII веках за контрабанду товаров, потребление которых в России было запрещено, а также за контрабандный ввоз и тайную торговлю товарами, являвшимися государственной монополией, были установлены жестокие телесные наказания. Так, за кормчество отсекали руки, ноги, били кнутом.
Суровому наказанию подвергались лица за ввоз и продажу табака, потребление которого вплоть до вступления на престол Петра I было запрещено. Виновных в продаже табака наказывали 20—30 ударами кнута, после которых, как пишет в своей книге «История телесных наказаний в России» Н. Евреинов, «на спинах несчастных не оставалось целой кожи даже ни на палец шириной, и они имели вид животных, с которых была содрана кожа. Тем не менее после всего этого каждому виновному в продаже табака привешивалась на шею пачка с табаком, и в таком виде, связанных за руки попарно и сопровождаемых по обе стороны прислужниками палача, преступников вели сперва из города, а затем обратно в Кремль, и все это время продолжали бить их кнутом».
