К возведению обители приступили в 1352 году, и собралось "же на место то множество народа, князья всей земли той, боляре да вельможи, и весь причет церковный, и монашествующие, и всяк возраст мужей и жен. Епископ же Иоанн благослови и освяти место сие, и по молитве водрузи крест, идеже престолу быть". Князь своими руками начал копать ров в основание церкви во имя Преображения Господня, его примеру последовали бояре, и в тот же день основание храму было положено.
Преподобный Евфимий с благословения святителя своими руками обтесал у северных врат храма (близ жертвенника) три больших камня для своей гробницы. Возведение храма закончилось в 1357 году; князь украсил его драгоценными иконами, святитель Иоанн освятил новую церковь, рукоположил преподобного праведного Евфимия во пресвитера, поставил его архимандритом новоустроенной обители и поручил ему собрать стадо словесных овец и наставить их на путь спасения.
Впоследствии благочестивый князь Борис Константинович дал много злата и серебра на сооружение братских келий и ограды, а также повелел возводить и другие монастырские здания. Но не только княжескими средствами устраивал преподобный Евфимий обитель, но также слезами и трудом великим. Подвизаясь днем на сооружении монастырских зданий, ночи он проводил в непрестанных молитвах, и вскоре к смиренному подвижничеству собралось около трехсот человек братии.
Иноками преподобный Евфимий руководил с духовной рассудительностью, учил их безропотному послушанию, чистоте и бескорыстию. Никому он не дозволял иметь какую-либо собственность, и если кто-то по наущению врага рода человеческого что-то утаивал, преподобный налагал на него епитимью. Строго запрещал он всякие разговоры в храме и трапезе; в кельи из трапезы тоже следовало идти молча и не заходить друг к другу, чтобы избегать празднословия. Все должны были быть готовы к смирению и безропотно переносить монастырские послушания.
Когда было закончено возведение Спасо-Преображенского храма, преподобный Евфимий испросил у святителя Иоанна благословение на возведение теплого храма во имя Иоанна Лествичника (с братской трапезной). Со временем был возведен и больничный храм во имя Николая Чудотворца, к которому потом пристроили обширную деревянную трапезу со всеми служебными помещениями.
Иногда ходил преподобный Евфимий в дремучие леса Радонежские к преподобному Сергию за духовным советом, и братски утверждали они друг друга в духовном подвиге.
