Отобранных людей распределяли по училищам для специальной подготовки, где они обучались от 3 до 6 месяцев. Закончившие курс с отличием могли поступить в Marineschule — военно-морское училище унтер-офицерского состава в Фридрихзорте. Многие кандидаты в унтер-офицеры на деле оказывались квалифицированнее кандидатов в офицеры, благодаря опыту и навыкам, полученным на флотской службе.
Обучение в Marineschule включало классные занятия по теории различных военно-морских дисциплин, строевую и спортивную подготовку. Отличная физическая форма была необходимостью, диктуемой специализацией подводников: узкие люки, недостаток пространства, колебание температур от холода до жары, духота, нервное напряжение и т. д. В 1935 г. подготовку унтер-офицерского состава увеличили за счет открытия еще одного учебного заведения — в Везермюнде. Тогда же оба училища получили соответствующие названия: Marineunterofficier-lehrabteilungen 1 (в Фридрихзорте) и Marineunterofficier-lehrabteilungen 2 (в Везермюнде). В 1938 г. в Плене открыли специальное училище для унтер-офицеров.
Требования к офицерскому составу подводного флота были чрезвычайно высоки, а срок службы был немалым — 25 лет. Стоит отметить, что в годы войны из подводников выжили немногие. Средний возраст командиров был около 27 лет. При этом все они без каких-либо исключений (в том числе родственно-фамильных) прошли тяжелую подготовку и жесткий отбор по интеллектуальным, физическим и психологическим параметрам.
Базовая подготовка офицеров начиналась со стандартной программы. Она длилась 5 месяцев. Физическое состояние прибывших кандидатов проверялось в отборочном офицерском лагере, находящемся в Денхольме. Эта обязательная процедура занимала всего 2 дня, однако не прошедшие физическую проверку в первый раз, получали второй шанс, при условии, что они смогли улучшить свою физическую форму до необходимого уровня. Далее была 4-месячная мореходная практика на 3-мачтовом парусном барке. Поскольку управление парусами неизменно связано с риском и получением травм, порой на борту происходили несчастные случаи, иногда со смертельным исходом.
Звание кадета (Seekadet) присваивали курсантам, завершившим первые две ступени с хорошими результатами. Дальнейшее их обучение проходило после назначения на военный корабль, чаще всего это был какой-нибудь крейсер. Вернувшись из плавания, эти будущие офицеры направлялись в Военно-морскую академию в Мюрвике на курсы длительностью 7 месяцев. После чего они становились фенрихами-цур-зее. Невзирая на будущую специализацию, до получения мичманского звания программа обучения была стандартной.
