Как только англичане вывели свои суда из опасного положения, они сразу выставили жесткие требования: Дания должна была выйти из союза, открыть свои порты Англии и разоружить все свои суда. Сначала крон-принц противился, рассчитывая выиграть время и дать возможность союзникам — России и Швеции — приготовиться к отпору. Но во время переговоров он узнал о смерти российского императора Павла I, который был душой союза. Надо было пользоваться тем, что до англичан это известие еще не дошло. Поэтому 9 апреля было заключено перемирие на 14 недель. Датчане обязывались не помогать в продолжение этого времени шведам и русским и позволить англичанам запасаться водой и провизией в датских портах.
Г. Нельсон понимал, что экспедиция только начинается, недостаточно было обезоружить Данию, надлежало не упустить русскую и шведскую эскадры. Он опасался, что потерял во время переговоров драгоценное время. 9 апреля Г. Нельсон писал графу Сент-Винценту. «Если бы от меня зависело, то я бы уже 15 дней тому назад находился бы у Ревеля, и ручаюсь, что русский флот вышел бы из этого порта не иначе, как с разрешения нашего Адмиралтейства».
12 апреля в Англию были отосланы наиболее поврежденные корабли с ранеными. В тот же день Паркер снялся с Копенгагенского рейда и с 16 линейными кораблями направился к Борнхольму, надеясь захватить шведский флот. Между тем шведская эскадра из семи кораблей, трех фрегатов и четырех малых судов получила приказ выйти из Карлскроны и идти в Копенгаген на помощь датскому флоту. Еще до ее выхода было получено известие о поражении датчан, но приказ атаковать англичан был подтвержден. 13 апреля шведы вышли в море и спустя два дня у Борнгольма встретились с английскими крейсерами, которые шли впереди Нельсона. Конечно, шведы были бы уничтожены, но в это время на эскадре был получен приказ возвратиться, и она, не встретив английскую эскадру, ушла в Карлскрону.
Паркер, уже находившийся на пути в Ревель, повернул к Карлскроне, к которой прибыл 20 апреля. А через два дня шведское правительство, уведомленное о смерти Павла I, выразило согласие на переговоры, которые закончились согласием шведского короля на прекращение «всех существовавших раздоров».
Только после этого Паркер направился к Ревелю. Однако 23 апреля к флоту пришел люгер с депешами от графа П.А. фон дер Палена, члена иностранной коллегии, руководившего при Павле I внешней политикой России. В них сообщалось о смерти Павла I и о том, что сменивший его на престоле Александр I приказал своему флоту «воздерживаться от неприязненных действий против англичан». Александр всего 40 дней на троне и не хочет, чтобы начало его царствования омрачилось военным конфликтом, у него есть возможность продемонстрировать свое миролюбие. Он решил отвести Ревельскую эскадру в Кронштадт. Вследствие этого Паркер повернул назад и 25 апреля встал на якорь в Кёгэ-бухте.
