Но еще до того как этот союз был заключен, 25 июля 1798 г. Павел I направил указ Ф.Ф. Ушакову о выходе его с эскадрой к Дарданеллам для оказания, в случае просьбы турецкого правительства, военной помощи против французов. «По получении сего имеете вы со вверенною в команду вашу эскадрою немедленно отправиться в крейсерство около Дарданеллей, послав предварительно авизу из легких судов к министру нашему в Константинополе господину тайному советнику Томаре, извесгя его, что вы имеете повеление от нас, буде Порта потребует помогли, где бы то ни было, всею вашею эскадрою содействовать с ними, и буде от министра нашего получите уведомление о требовании от Блистательной Порты вашей помощи, то имеете тотчас следовать и содействовать с турецким флотом противу французов, хотя бы то и далее Константинополя случилось».
Спустя две недели император уточнил задачу флота: «...буде нужда потребует, можете действовать соединенно с турецким флотом как у Дарданелльских крепостей в Мраморном море, так и в самом Архипелаге; равномерно, имея мы союз и с Великобританией и одну цель с нею, благосостояние соединенных держав, дозволяем вам, когда обстоятельства потребуют, действовать соединенно с английскою эскадрою, находящейся в Средиземном море и делающею поиски над хищным французским флотом.
Пределы, до которых плавание ваше быть должно в Средиземном море, имеют распространиться не далее Египта, Кандии, Морей и Венецианского залива, смотря по нужде и обстоятельствам…»
Эскадра под командованием Ф.Ф. Ушакова 13 августа 1798 г. вышла из Севастополя к Дарданеллам: 6 линейных кораблей, 7 фрегатов и 3 малых судна. На вооружении они имели 792 орудия и насчитывали 7406 человек команды, из них 1700 морских солдат. На всех судах кроме экипажей находились офицеры и солдаты морских полков — от 240 на 84-пушечных кораблях до 13 на акате.
Одновременно с выходом эскадры, в Константинополь на быстроходном авизо «Панагия Апотуменгано» отправился лейтенант А.Н. Тизенгаузен с письмами от Ф.Ф. Ушакова к министру двора, тайному советнику В.С Томаре, с просьбой сообщить, достигнуто ли соглашение с Турцией о совместных действиях против французов и о возможности беспрепятственного входа в Босфор. 19 августа Томара пишет Ушакову письмо о решении Турции заключить с Россией оборонительный союз против французов.
При следовании эскадры к Босфору она попала в шторм, и корабль «Св. Троица» и акат «Ирина», получившие повреждения, были отправлены в Севастополь для исправления повреждений. В конце августа они присоединились к эскадре.
