Правление Газана, ставшего победителем в этой гражданской войне, было отмечено постепенным движением к ассимиляции в иранской культуре. Рассматривая себя как мусульманского правителя, и больше не как вассала Великого хана, Газан даже откажется от титула ильхана. Однако было бы неверно видеть в этом разрыв между чингизидскими Ираном и Китаем, совсем напротив, так же как было бы большим упрощением представлять это как автоматический союз с другими мусульманскими государствами. Ведь в 1303 году Газан будет вести безрезультатную войну против мамелюков за контроль над Сирией. И известно, что он вел дипломатическую переписку с Папой Римским Бонифацием VIII, тоже врагом мамелюков!
Преемники Газана не сумели сохранить ни единство, ни силу империи Иль-ханидов. В 1335 году империя вновь оказывается разделенной на четыре государства. Чобаниды, недолговременные монгольские преемники Ильхани-дов; Джалаириды, мусульманская монгольская династия, правившая Анатолией и Багдадом — затем Басрой — еще столетие. Музаффариды, иранизиро-ванные арабы, захватившие юг Персии, тогда как Инджуиды быстро истратили свои силы в заговорах и интригах против них, но главным образом против самих себя.
Ханство Чагатая
Второй сын Чингисхана Чагатай (Джагатай) получил в качестве своего удела ханство, которое скоро получит его имя и которое приблизительно соответствовало бывшему государству каракитаев, одной из ветвей киданей, живущих между ильханами, Делийским султанатом и Китаем династии Юань. В отличие от других ханств, это ханство пыталось сохранить традиционный кочевой образ жизни монголов. Под этим предлогом в нем не было постоянной столицы.
Однако если иностранная династия не может заставить своих подданных принять свои обычаи, у нее нет другого выбора, кроме как самой приспособиться к местным обычаям. Таким образом, под давлением мусульманской элиты ханам Чагатайского улуса пришлось перейти к оседлому образу жизни и принять ислам. Очень рано ханство стали разрывать династические конфликты, возможно, даже больше, чем в другом месте. Оно часто вело войны с монгольским миром с одной стороны, будь то Юань или Ильханиды, и с Делийским султанатом с другой стороны, куда они неоднократно вторгались и осаждали Дели.
В начале четырнадцатого века хан Тармаширин переходит в ислам, что спровоцировало восстание и разделение на части глубоко разделенной страны. На востоке это был буддистский и несторианский Могулистан, сельскохозяйственный и кочевой, но тонущий в племенной анархии, а на западе Мавераннахр, который был в большинстве своем городским, торговым и мусульманским. Единство было восстановлено только к 1360 году, когда чингизид Тоглук-Тимур ради присоединения Трансоксианы прислушался к призывам к союзу с тюркской элитой, со всем своим войском перешел в ислам и захватил этот регион. В свою очередь он назначил аристократа Барласа в качестве своего представителя. Но Барлас нарушил вассальную связь и сам провозгласил себя эмиром Самарканда вместо эмира. Вопреки стойкой легенде, Тимур-ленг, которого история знает под именем Тамерлана (Тимура), был не монголом, а тюрком.
