В 1634 г., сразу после атаки мусульманского флота, иезуиты потребовали у генерал-губернатора строительства укрепленного испанского форта на северо-западном побережье Минданао.
Испанцы выстроили такой форт в Замбоанге (поблизости от старой испанской крепости Ла Кальдера) в 1635 г. Форт защищали артиллерийские орудия, гарнизон из 300 испанцев и около тысячи солдат-висайя. Из Замбоанги стали отправляться эскадры для нападения на моро (прежде они формировались в более удаленных от мусульманских районов Висайев).
В конце 30-х годов испанские колонизаторы провели несколько наступательных операций против моро. Военной кампанией руководил генерал-губернатор Себастьян Уртадо де Коркуэра, выдвинувший весьма амбициозный план покорения моро: пленение Кударата и султана Сулу, разрушение мусульманских фортов и укреплений, «замирение» Минданао и христианизация населения Магинданао и Сулу. Честолюбивым замыслам Коркуэры не суждено было осуществиться, хотя испанцам в 1637 г. удалось нанести поражение войскам моро в районе оз. Ланао на Минданао (входившем в султанат Магинданао) и тяжело ранить Кударата. Местные жители (ирануны) сумели переправить Кударата во внутренние горные районы, куда ушли и отряды его воинов (около 2 тыс.). Таким образом, Кударат сохранил значительные военные силы. Коркуэра назначил вознаграждение в 4 тыс. песо тому, кто выдаст Кударата живым или мертвым, но среди моро не нашлось ни одного предателя.
Иначе, чем предполагал Коркуэра, развертывались военные операции в Сулу. Отправленная в январе 1638 г. из Замбоанги сильная военная эскадра приблизилась к Холо, но нашла город пустым: султан, его приближенные и все население скрылись в крепостях на соседних островках. Испанцы заняли город, где вскоре началась сильная эпидемия холеры. В апреле 1638 г. испанские корабли ушли в Замбоангу. Коркуэра приказал выстроить в Холо форт и оставил там 400 солдат и двух монахов-иезуитов. Одним из них был Алехандро Лопес, к дипломатическому искусству которого впоследствии не раз обращались испанские генерал-губернаторы.
Кударат, занятый тогда консолидацией мусульманских сил, подписал в 1639 г. мирный договор с испанцами, действовавший до 1642 г. В начале 40-х годов Кударат не только восстановил свою власть, но и значительно расширил границы султаната — почти на всю территорию о-ва Минданао.
Возобновившиеся с 1642 г. военные столкновения между испанцами и войсками Кударата свидетельствовали о явном перевесе сил мусульман. Как нельзя кстати для Кударата был испано-голландский военный конфликт 1645 г., поставивший испанцев в чрезвычайно сложное положение. Сменивший Коркуэру генерал-губернатор Алонсо Фахардо отказался от агрессивной тактики своего предшественника, стараясь добиться хотя бы временного мира с опасным и сильным южным соседом — султаном Кударатом. С дипломатической миссией в Магинданао был отправлен иезуит Алехандро Лопес, которому удалось подписать мирный договор с Кударатом в июне 1645 г. Согласно договору, испанцы признали власть Кударата на Минданао — к востоку от Замбоанги до залива Давао и в горных районах на территории современных провинций Котабато и Букиднон.
