В начале июня сводный отряд, состоявший из кавалерийской дивизии и двух кавалерийских бригад, в том числе бригады Г.И. Котовского, под общей командой И.П. Уборевича разгромил часть сил Антонова у станции Инжавино. 20 июня остатки этих войск были разгромлены в бою у Урюпинска. Другая часть мятежников под командой А. Богуславского ушла на Дон, а затем в Воронежскую губернию. К тому времени, начиная с 28 мая 1921 года, по официальным данным, антоновцы потеряли убитыми 4515 человек и было взято в плен в бою около 1 тысячи человек. Кроме того, было взято в облавах с оружием 572 и без оружия 7713 человек, сдалось добровольно с оружием 1260 и без оружия — 4350 человек. Всего 16 370 человек.
Последний крупный отряд антоновцев численностью около 500 человек был разгромлен в июле 1921 года бригадой Г.И. Котовского. Сам Александр Антонов с братом и небольшой группой сторонников скрылся в тамбовских лесах. 24 июня 1922 года он был застрелен в бою в селе Нижний Шибрай.
М.В. Фрунзе, будучи делегатом X съезда партии, принимает участие в подавлении кронштадского восстания, а затем, как командующий всеми вооруженными силами Украины, являлся одним из основных организаторов подавления крестьянских восстаний на территории этой республики. Против восставших крестьян и незаконных воинских формирований, которые называли «бандитскими», был проведен ряд карательных операций, в которых участвовали все рода войск. В ходе этих операций блокировались и расстреливались артиллерией мятежные населенные пункты, которые затем тщательно «зачищались». В ходе этих «зачисток» арестовывались практически все мужчины в возрасте от 18 до 60 лет, которые в последующем становились заложниками. В случае возникновения новых беспорядков или действий, направленных против советской власти на местах, заложники расстреливались.
Советские исследователи жизни и деятельности М.В. Фрунзе всячески старались не высвечивать эти стороны его биографии. В то же время в архиве имеется большое количество документов, свидетельствующих о карательной деятельности М.В. Фрунзе на Украине. Так, в частности, в одном из приказов он требует: «Бандитское сопротивление должно быть подавлено повсеместно самым жестким образом. Не нужно бояться того, что при этом могут пострадать невиновные. Села, дающие приют и пропитание бандитам, разрушать артиллерией и сжигать. Всех подозрительных допрашивать и задерживать».
