Некоторые исследователи утверждают, что приказ о ликвидации Щорса был отдан самим наркомом и главой РВС Л. Троцким, который любил устраивать чистку среди командирского состава Красной армии. Версию, связанную с Араловым и Троцким, историки считают вполне вероятной и к тому же отвечающей традиционному восприятию Троцкого как злого гения Октябрьской революции.
Согласно еще одному предположению, смерть Н. Щорса была выгодна и «революционному матросу» Павлу Дыбенко, личности более чем известной. Муж Александры Коллонтай, старый партиец и друг Ленина, Дыбенко, занимая в свое время пост главы Центробалта, предоставил большевикам в нужный момент отряды матросов. Ленин это помнил и ценил. Дыбенко, не имевший образования и не отличавшийся особыми организаторскими способностями, постоянно выдвигался на самые ответственные государственные посты и военные должности. Он же с неизменным успехом проваливал дело везде, где только появлялся. Сначала упустил П. Краснова и других генералов, которые, пойдя на Дон, подняли казаков и создали белую армию. Потом, командуя матросским отрядом, сдал немцам Нарву, после чего не только лишился занимаемой должности, но и потерял партбилет. Неудачи и дальше преследовали бывшего балтийского матроса. В 1919 году, занимая должность командующего Крымской армией, местного наркома по военным и морским делам, а также главы Реввоенсовета Крымской республики, Дыбенко сдал Крым белым. В скором времени, тем не менее, он возглавил оборону Киева, которую бездарно провалил и бежал из города, бросив Щорса и его бойцов на произвол судьбы. Возвращаясь к его возможной роли в убийстве Щорса, следует отметить, что как человек, который вышел из бедноты и успел ощутить вкус власти, Дыбенко панически боялся очередной неудачи. Потеря Киева могла стать началом его конца. А единственым человеком, который знал правду о том, как Дыбенко «успешно» оборонял Киев, был Щорс, к словам которого могли прислушаться. Все перипетии этих боев он знал досконально и к тому же имел авторитет. Поэтому версия о том, что Щорса убили по приказу Дыбенко, не кажется такой уж невероятной.
Но это еще не конец. Существует еще одна версия гибели Щорса, которая, однако, едва ли ставит под сомнение все предыдущие. Согласно ей, Щорс был застрелен собственным охранником из ревности. А вот в сборнике «Легендарный начдив», изданном в сентябре 1935 года, в воспоминаниях вдовы Щорса, Фрумы Хайкиной— Ростовой, приводится четвертая версия его гибели. Хайкина пишет, что ее муж погиб в бою с белополяками, однако не сообщает никаких подробностей.
