За последующие годы Тамерлан разграбил все города Малой Азии, в том числе и Смирну, принадлежавшую рыцарям-иоаннитам. В 1402 году он подошел к стенам Смирны, занятой гарнизоном крестоносцев. Турки осаждали Смирну 20 лет и не могли ее взять, а Тимур взял крепость штурмом за несколько дней. Когда же к городу прибыли венецианские и генуэзские корабли с подкреплением и продовольствием для осажденных, воины Тамерлана забросали их из катапульт головами рыцарей ордена Иоанна…
Немного позднее западная часть Малой Азии была возвращена сыновьям Баязида, в восточной были восстановлены низложенные Баязидом мелкие династии. В Багдаде (где Тимур восстановил свою власть в 1401 году) был назначен правителем сын Мираншаха Абу-Бекр.
В 1404 году легендарный властитель Средней Азии вернулся в Самарканд, расплатился с войском и принялся за подавление мятежей в вечно бунтовавшем Могулистане. И в том же году Амир Тимур предпринял поход в Китай, к которому начал готовиться еще в 1398 году. Тогда им была построена крепость на границе нынешней Сырдарьинской области и Семиречья. Теперь же по приказу эмира было построено еще одно укрепление, в десяти днях пути дальше к востоку, вероятно, около Иссык-Куля. Тимур выступил в поход в конце декабря. В январе 1405 года великий полководец со своим войском прибыл в город Отрар (его развалины находятся недалеко от впадения Арыси в Сырдарью), однако планам доблестного воителя не суждено было реализоваться – по дороге в Китай непобедимый воитель заболел. Лежа на смертном одре, Тимур сказал: «Не нарушайте покой моей могилы, ибо того, кто меня побеспокоит, ожидает судьба страшнее, чем я». 15 (судя по надписи на гробнице) или 18 (по мнению исследователей) февраля 1405 года в возрасте 69 лет великий воин, мудрый эмир, непобедимый завоеватель Амир Тимур (Тамерлан) умирает от болезни в Отраре.
В отличие от неожиданной смерти Александра Великого, которая (хотя некоторые источники пытаются объяснить ее весьма обыденно: внезапным недугом молодого полководца) произошла при весьма подозрительных обстоятельствах, нет оснований предполагать, что смерть Тамерлана наступила не от так называемых «естественных» причин. Тяжелая болезнь и преклонный возраст сделали свое дело.
Перед смертью Тимур разделил свои территории между двумя оставшимися в живых сыновьями и внуками. Однако после смерти грозного завоевателя вспыхнула война, длившаяся много лет, по причине несогласия с оставленным Тимуром завещанием. В конце концов в 1420 году потомки Тамерлана были объединены единственным оставшимся в живых прямым наследником доблестного полководца Шахрухом, который получил власть над владениями отца и престол в Самарканде.
