Следствие по делу "буржуазно-националистического центра" продолжалось ровно три года. Так как не было возможности судить "центр" в 137 человек одним судом, то в ходе предварительного следствия он был разбит на три группы: 1) советско-партийное руководство (Горчханов, Саламов, Вахаев, Окуев, Тучаев и др.); 2) беспартийные группы: культурно-идеологическое руководство (Яндаров, Мациев, Авторханов, Д.Мальсагов, Мамакаев и другие); 3) "террористическая группа" (Сапаров, Ермолов, Товбулатов и другие). В эту "группу" чекисты набрали по логике вещей одну молодежь. Следствие велось с применением обычных для всего СССР методов физических пыток с некоторой добавкой для специфического "национального характера". Во время этого следствия до смерти были замучены: бывший председатель областного исполнительного комитета Д.Мачукаев, бывший завкультпропом обкома М.Гисаев, бывший секретарь Ингушского обкома ВКП(б) Идрис Зязиков и другие. Не выдержав режима пыток, покончили самоубийством: председатель плановой комиссии республики М.Исламов, секретарь райкома партии М.Бектемиров. Путем этой неслыханной инквизиции, названной "предварительным следствием", чекисты заставили до 90 процентов членов "буржуазно-националистического центра" подписывать и даже сочинять "искренние признания" в преступлениях, которых они, разумеется, не совершали.
О фантастичности этих показаний можно судить хотя бы по тому, что бывший заместитель правительства республики А.Саламов дал следующие "искренние собственноручные показания". Для успешного проведения вооруженного восстания в Чечено-Ингушской республике из Англии через Турцию были получены: 50 горных орудий, 1000 пулеметов, 200 тысяч винтовок, 5 миллионов патронов, 10 тысяч снарядов и гранат и т.д. Кроме того, Англия обещала с воздуха поддерживать это восстание. Но так как Саламов указывал и точное место, где это оружие зарыто в горах, то чекисты изрыли все указанные ущелья гор. При этом, конечно, ничего не нашли, но избиения продолжались с требованиями указать подлинное место, где зарыто это оружие.
Наконец, когда "следствие" было закончено и группы "центра" предстали перед военным трибуналом Северокавказского военного округа, то из дошедших живыми до суда около 120 человек виновным себя признал только один бывший мулла Ахмат Тучаев. Все остальные в один голос заявили, что все инкриминируемые им преступления – выдумка и их "искренние признания" являются ложными и вымышленными от начала до конца. Подсудимые, указывая на шрамы от нанесенных ран, на выбитые зубы, изуродованные части организма (один даже был кастрирован во время допроса), заявили, что свои ложные показания они подписали под влиянием этих физических пыток и в надежде, что таким образом будет ускорен день суда, или смерти. Все обвинение и доказательства по делу строились исключительно на этих вынужденных пытками личных показаниях.
