16 мая 1918 г. С. Коморный был отстранен от управления Одессой и Югом Украины, а вся полнота власти в Одессе перешла к комиссару города Ивану Липе, котрого гетманский режим планировал заменить генералом Н. Березовським. Главный Краевой Комиссариат и местные комиссариаты в городах и уездах Украины розформировывались, комиссары увольнялись. Вскоре появилась новая структура управления в виде староств, во главе с губернськими и уездными старостами — руководителями местной администрации.
При гетмане Херсонская губерния разделялась на уезды, которыми управляли старосты, а город Одесса выделялась из Херсонской губернии как отдельная административная единица — градоначальство. Власть в Одессе в мае 18-го перешла к городскому атаману (градоначальнику) генералу В. Мустафину, что был приверженцем диктаторских методов управления и враждебен к украинской жизни. В. Мякотин в своих воспоминаниях писал, что В. Мустафин «…упорно стремившегося восстановить в Одессе порядки дореволюционной эпохи… этот градоначальник добился закрытия Одесской городской думы, избранной в 1917 г., и передачи городского хозяйства в ведение старой, дореволюционной управы». Одесская городская Дума была разогнана, а демократически избранный городской голова В. Богуцкий (что возглавлял Думу с октября 1917 г.), заменен генерал-лейтенантом А. Санниковым.
Вскоре последовали: разгон Советов, закрытие большинства профсоюзов, либеральных земств и аресты, как «левых» так и сторонников Антанты — «оборонцев», в том числе и гласных (депутатов) Городской Думы.
Одесса страдала от возрастающей (до 30 тыс. человек) безработицы, голода, карточной системы, эпидемии холеры. Австро-германское командование бесконтрольно вывозило с Одесского региона: продукты, сырье, оборудование предприятий, провело насильственное разоружение населения.
Гетманский режим строго запрещал рабочие стачки и забастовки. Но в Одессе, уже в мае 1918 г. бастовали 15 кожевенных заводов, а вскоре к забастовке кожевников присоединились одесские пекарни. В июле 1918 г. власть была парализована всеобщей забастовкой железнодорожников. 13 тысяч железнодорожников Одессы, Раздельной, Бирзулы примкнули к бастующим, что требовали выплаты зарплат, восстановления профсоюзов, 8-ми часового рабочего дня, либерализации режима.
Эта забастовка была поддержана забастовками на канатных и кожевенных заводах Одессы.
Власть жестоко расправилась с забастовщиками, а австро-немецкое командование грозила им военно-полевым судом. Несколько тысяч железнодорожников было арестовано или уволено, 300 человек выслано из Одессы.
