В июле 1914 г. призван в армию. Службу проходил в должности врача 13-й Тобольской дружины и старшего врача Сибирского казачьего артиллерийского дивизиона. Участник Первой мировой войны в составе войск Западного фронта. После Февральской революции был избран в состав солдатского комитета дивизиона. Принимал участие в формировании отрядов Красной гвардии в г. Омске. Член большевистской партии с 1917 г.
В Красной Армии с марта 1918 г. Во время мятежа чехословацкого корпуса командовал отрядом коммунистов в г. Омске. Затем последовательно занимал должности: в 1918 г. —командир Камышловского стрелкового полка; в 1919 г. —для поручений при начальнике штаба Западного фронта, начальник разведывательного отдела этого штаба; в 1920 г. — врид начальника штаба 3-й армии, начальник оперативного отдела штаба 16-й армии, начальник штаба
и командир 10-й стрелковой дивизии, командир отдельной стрелковой бригады. В марте 1921 г. участвовал в подавлении мятежа в Кронштадте в должности помощника командующего войсками Северной группы войск.
После Гражданской войны окончил Военную академию РККА (в 1921 г.). В том же году назначен начальником штаба частей особого назначения (ЧОН) Республики. С марта 1924 г. — второй помощник начальника разведывательного отдела Штаба РККА. С октября 1925 г. находился в заграничной, командировке— работал начальником Главного штаба Монгольской Народной Армии. С февраля 1928 г. —заместитель начальника штаба Кавказской Краснознаменной армии. С июня того же года — начальник учебного отдела Курсов усовершенствования высшего начсостава при Военной академии имени М.В. Фрунзе. С марта 1930 г. — начальник и комиссар Военно-медицинской академии РККА. В феврале 1934 г. зачислен в резерв РККА ввиду назначения первым заместителем наркома здравоохранения РСФСР. В апреле 1936 г., зачислен в кадры РККА с оставлением на работе в Наркомате здравоохранения РСФСР. Награжден двумя орденами Красного Знамени.
Арестовали В.А. Кангелари 17 июня 1937 г. Следствие длилось недолго, всего полгода, — видимо, сотрудники ГУГБ НКВД СССР считали его дело не самым трудным. Обвинялся Валентин Александрович по известной схеме: шпионаж, участие в военном заговоре, вредительство в области здравоохранения. Эти обвинения базировались на показаниях арестованных по другим делам, а также на показаниях самого Кангелари. Методы добычи таких показаний известны, о них мы не раз уже рассказывали. И в случае с Кангелари здесь ничего не изменилось — те же допросы, угрозы, шантаж, избиения, очные ставки, камеры-одиночки, предъявление уличающих показаний бывших сослуживцев.
