Новыми врагами Священного Альянса постнаполеоновской эпохи стали разбойники и члены тайных обществ, в частности carbonari (карбонарии). Именно карбонарии организовали восстание в Романье, и для его усмирения Лев XII решил послать кардинала Агостино Риварола: папа надеялся, что он мирно уладит конфликт. Но он не знал, что Риварола получил от кардинала Пакка одобренные государственным секретарем кардиналом Сомалья четкие инструкции покончить с восстанием во что бы то ни стало.
На самом деле никто особенно не принимал карбонариев всерьез. Их считали просто бандитами. Но с начала XIX века в Неаполе, Милане и Калабрии образовались многочисленные секты, зародившиеся в основном в недрах масонских лож и, следовательно, неоднократно запрещавшиеся различными буллами различных пап. Члены обществ carbonari, protectores, independientes, calderari, furegrinos blancos или mafia официально преследовались на территории папских областей организациями, находившимися под контролем Ватикана, такими, как Священный Альянс, а неофициально — при помощи небольших тайных объединений, которые создавались отдельными священнослужителями и осуществляли карательные операции. Среди них были и возродившийся «Черный Орден», и «Круг Октагон», и другие, менее известные объединения, например «Черные одежды», «Общество Тринадцати» или «Последователи Христа».
Агентам Священного Альянса было известно, что во главе карбонариев стоят два человека — Анджело Таргини н Леонидо Монтанари. Но первая попытка арестовать этих людей привела к тому, что один агент шпионской службы был застрелен, а другой тяжело ранен. Бартоломео Пакка жаждал разыскать главарей карбонариев и предать их понтификальному суду.
20 ноября 1825 года Таргини и Монтанари, обманутые неким папским шпионом, выдававшим себя за члена организации карбонариев, были во время встречи с ним арестованы агентами Священного Альянса и солдатами понтификальной гвардии. 21 ноября их перевезли в Рим, 22-го они предстали перед судом, а 23-го были обезглавлены как виновные в нанесении оскорбления римскому папе. Но война между карбонариями и агентами Священного Альянса на этом не закончилась.
Кардинал Риварола, правая рука кардинала Пакка, всерьез занялся тем, чтобы покончить с повстанцами одним ударом. Опираясь на тайную секту под названием sanfedisti («защитники святой веры»), Риварола и агенты Священного Альянса развязали настоящую войну. Тех, кого подозревали в том, что они являются карбонариями или даже только поддерживают это движение, похищали, подвергали допросу под пыткой и в большинстве случаев казнили самым жестоким образом. Полтысячи человек отправились в изгнание или в папские тюрьмы. Когда папа Лев XII узнал о тайных операциях Священного Альянса против карбонариев, которые осуществлялись с молчаливого одобрения государственного секретаря, он отправил в отставку Джулио делла Сомалья, однако могущественного кардинала Пакка не тронул.
