Далее события разворачивались так. Было заведено уголовное дело о хищении 5,4 миллиардов рублей, был установлен Коробейников, который знал, каким образом к нему деньги приходили и уходили, и которого необходимо было допросить.
12 сентября 2008 года возбуждается уголовное дело по хищению 5. 4 миллиардов рублей. Начинают разыскивать Коробейникова, чтобы допросить. Но 24 сентября его труп находят на стройке: он выпал с балкона. Причина смерти — падение с высоты. А вскрытие показало: его сердце сильно увеличено, что свидетельствует о том, что перед падением у него, скорее всего, случился сердечный приступ. Этот важнейший свидетель и потенциальный обвиняемый тоже умер. Кстати, весной 2008 года скончался от сердечного приступа и один из трёх директоров, которые совершали непосредственно хищения — Курочкин. К сентябрю 2008 года уже три важнейших свидетеля были мертвы.
Далее Магнитского стали приглашать по делу о налоговом преступлении, речь зашла о предъявлении ему обвинений. Магнитский остался единственным человеком в России, кто знал Браудера, работал с ним и мог дать на него показания, все остальные были либо в Великобритании, либо скончались. К ноябрю 2008 года все дела по неуплате налогов компанией Браудера скапливаются в следственной части Следственного комитета МВД: из Татарстана забирается уголовное дело о махинациях, из Калмыкии, из Москвы. Дела объединяются. Расследование поручается следователю Сильченко.
Со стороны компании Браудера звучали обвинения, что преступления расследовали те лица, которых Магнитский обвинял в хищениях. Но, как уже было сказано, он никого в хищениях не обвинял. Что касается расследования, действительно, первая следственная группа включала в себя следователей, которые работали над делами в Калмыкии, Татарстане и Москве. Таков порядок: когда принимается решение об объединении дел, то поначалу все следователи остаются в группе, потому что они должны дела передать. Следователи передают дела руководителю следственной группы, которым был Сильченко.
В ноябре 2008 года поступает информация о том, что Магнитский собирается уезжать в Великобританию: он идёт в фотоателье, а на тот момент оперативники его уже опекали, фотографируется на британскую визу. Поступила также информация, что Магнитский заказал билет в Киев. То есть, может улететь, не дожидаясь в Москве паспорта, который ему передадут в посольстве Великобритании на Украине. Кроме того, Магнитский активным образом воздействовал на свидетелей по делу, склоняя их к даче ложных показаний.
