Ум и деятельность такого правления благоприятно сказывалась для величия России. Годунов был предметом злой зависти, несмотря на его искусство в обольщении людей. Переписываясь от своего имени с монархами Европы и Азии, посылая им подарки, принимая у себя иностранных послов, он хотел казаться скромным, однако одним взором или движением пальца мог заставить трепетать боярские сердца.
Духовенство российское никогда сильно не лезло в дела государственные более угождая, чем противясь воле государей, занималась более устройством богослужением и спасением душ христианских, однако присутствовало в Думе при приеме важных государственных решений, одобряя или утверждая законы гражданские, советовала царю и боярам и толковала им каноны Царя Небесного для земного блага людей. Феодор превосходил иерархов церкви в набожности, занимаясь делами церкви охотнее, чем государственными, беседовал с монахами чаще, чем с боярами. Годунов не для того хотел власти, чтобы делиться ею с иерархами, слушал представителей духовенства, выражал знаки внимания, но поступал по своему.
Россия наслаждалась миром, которого ни когда не было в душе Годунова. Не видя никого вокруг себя, кроме льстецов, громко славящих его достоинство, при чем не только в кремлевском дворце, но и на окраинах России, Годунов имел все, кроме короны Феодоровой. Надменный своими достоинствами и заслугами, упоенный счастьем и славою, поднявшись на высоту, на которую не поднимался ни один подданный до него, Борис хотел большего, хотел властвовать своим именем. Ожидая смерти хилого, болезненного, бездетного царя, располагая думой, наполненной друзьями и родственниками, надеясь на блеск своего правления, он не сомневался в преданности народа и иерархов церкви. Приступая к выполнению своей давней мечты – выбора новой династии для России – он видел перед собою и троном только одну помеху, которая заключалась в юном царевиче Дмитрии.
Приступая к исполнению своего страшного намерения, Годунов решил отравить Дмитрия. Выбор его пал на боярыню Василису Волхову – воспитательницу царевича, однако по иронии судьбы яд на него не подействовал. По совету своего родственника – окольничего Андрея Клишина – Борис призвал к себе дьяка Михаила Битяговского. Один взгляд на этого человека вызывал омерзение. Годунов осыпал его золотом, пообещав абсолютную безопасность и милость в будущем, отправил его в Углич. Дьяк пообещал хранить тайну и отбыл к месту, взяв с собой сына Данилу и племянника Никиту Качалова. При помощи Василисы Волоховой они быстро вошли в доверие к вдовствующей царице и занимались ее домашним обиходом. Прошло немало времени, а они не видя возможности совершить убийство в тайне, решили сделать это, открыто, надеясь на Годунова. 15 мая 1591 года царица возвратилась с Дмитрием из церкви к обеду. Боярыня Волхова позвала царевича гулять во дворе, вывела его из горницы на крыльцо, где его поджидали убийцы. Сын Волоховой – Осип, взяв одной рукой царевича за руку, другой потянулся к висящему у него на груди к драгоценному кресту, и сказал:
