Подлески представлены разнообразными кустарниками, преимущественно ягодными. Везде можно встретить черную и красную смородину, черемуху, рябину, бруснику, чернику, калину, малину. Особенно много черной и красной смородины по долинам всех впадающих рек и по всему побережью озера, а в тайге на всех уровнях от берега озера до зоны горной тундры масса черники. Черника очень крупных размеров. В долине Чулышмана - большие заросли облепихи, из ягод которой вырабатывают ценнейшее лекарство - облепиховое масло.
Прибрежные скалы покрыты зарослями вечно-зеленого кустарника— маральника, в науке - рододендрона даурского. И везде по склонам гор и в глубине тайги заросли довольно грубого кустарника — таволги трехлопастной.
Более 1200 видов растений насчитывает флора бассейна Телецкого озера.
Обилие осадков сказалось и на травяном покрове. Травы на таежных полянах по всему северному побережью озера достигают двух и более метров в высоту. Особенно высоки зонтичные. Отдельные экземпляры этого вида достигают трех и более метров.
Травяной покров в тайге, наоборот, довольно скудный, здесь преобладают мхи. Травянистые растения немногочисленны, с бледно окрашенными мелкими цветами.
В целом Горный Алтай с его благоприятными климатическими условиями является одним из богатейших регионов России, где богатство флоры позволяет производить большие сборы лекарственных растений по видам и по объему.
Масса различных лекарственных трав произрастает в прителецкой тайге. Среди них особенно выделяются такие ценные для медицины виды -родиола розовая (золотой корень), левзея сафлоровидная (маралий корень), пион (Марьин корень), зверобой продырявленный, тысячелистник, бадан толстолистный, серебрянка, аир болотный, кровохлебка лекарственная, мать-и-мачеха, пижма обыкновенная, белоголовник и другие. Больше всего бадана. На крутых склонах гор, на высоких скалах - везде заросли этого крупнолистного кожистого растения, высохшие черные листья которого употребляются для приготовления лекарственного чая.
Весной и в начале лета поляны покрываются всевозможными цветами крупнотравья. Особенно много ярко-оранжевых огоньков, фиолетовых кандыков, синих водосборов, ярко-желтой пижмы, малиновых гвоздик и везде - белые шапки зонтичных.
Несколько позднее появляется масса крупных нежно-белых метелок белоголовника, который местные жители собирают и включают в состав необыкновенно ароматного травяного чая.
В труднодоступных местах долины реки Чулышман, около водопадов и на небольших выступах скал можно увидеть скромный белого цвета эдельвейс, который стал как бы постоянным спутником альпинистов.
