После подписания руководством Католической церкви в 1929 го. конкордата с Италией, восстановившим государство Ватикан, а в 1933 го. - с Германией (со стороны Ватикана его подписал как раз Пий XII, который был тогда еще только кардиналом Пачелли, а со стороны Германии - вице-канцлер Франц фон Папен), оно активно сотрудничало с фашистским и нацистским режимами, что облегчалось тем, что большинство их лидеров были римо-католиками.
На Гитлера, Гиммлера, Геббельса, Шелленберга и др. сильное влияние оказали, в частности, иезуиты. В. Шелленберг. глава службы безопасности СС, в своих мемуарах, например, указывал: "У Гиммлера было лучшее и крупнейшее собрание книг об ордене иезуитов. Годами он изучал по ночам эту обширную литературу. Поэтому организацию СС он построил по принципам ордена иезуитов. При этом он опирался на устав ордена и труды Игнатия Лойоды: высшим законом было абсолютное послушание, беспрекословное выполнение любого приказа. Сам Гиммлер как рейхсфюрер СС был генералом ордена. Структура руководства походила на иерархическую систему католической церкви". Не случайно Гитлер говорил о Гиммлере: "Я вижу в нем нашего Игнатия Лойолу". Что же касается Франца фон Папена, называвшего себя ревностным католиком и являвшегося рыцарем Мальтийского ордена, то именно ему принадлежат слова: "Третий рейх - это первая держава в мире, которая воплощает в жизнь принципы папства".
С началом войны Пий XII отказался объявить Германию агрессором и, провозгласив нейтралитет, до самого окончания военных действий не сделал никакого заявления в пользу той или иной стороны. При этом, как пишет исследователь Карло Фалькони, изучивший многочисленные архивные документы Польши и Югославии, Ватикан, представляя собой самое значительное разведывательное агентство в мире, был в курсе малейших деталей, связанных с военными событиями, так что Пий XII был прекрасно информирован о тех методах, которые применяли нацисты в отношении своих жертв как в Центральной и Восточной Европе, так и в Советской Союзе. Однако католические иерархи не только не выступали в защиту преследуемых, но и запрещали это делать.
С экспансией нацистской Германии Св. Престол связывал большие надежды на осуществление окатоличивания восточных славян и восстановление своих позиций на западной территории Советской России. Св. Престол открыто поддерживал профашистские режимы, установленные в Восточной Европе, особое покровительство оказывая уставам и Ане Преувеличу, главе Независимого Государства Хорватии, созданного в апреле 1941 го. и находящегося под жестким контролем немецких и итальянских властей. НИХ рассматривалось Кием XII как "великий авангард христианства на Балканах", а о Павелецкие папа отзывался как о "хорошем католике и хорошем человеке". В свою очередь Павелецкий в отправленном папе письме заявил, что именно понтифику принадлежит честь создания Независимого Государства Хорватии.
