По Второму Торуньскому миру, подписанному 19 октября 1466 года, Польша возвратила себе земли Восточного Поморья с городом Гданьском, получив снова выход к Балтийскому морю. К Польше вернулись исконные польские земли Хелминьская и Михаловская с городом Торунем, а также западная часть владений Ордена в Пруссии с городами Мариенбург (Мальборг), Эльбинг (Эльблонг) и Вармия. Новую Махию с городами Санток и Дрезденко Орден еще в начале войны успел продать герцогу Бранденбургскому, и поэтому они остались в руках немцев.
Территория Тевтонского ордена уменьшилась почти вдвое. Орден признал себя вассалом польской короны и потерял самостоятельность. Резиденция гроссмейстера была перенесена в Кенигсберг, — крупнейшую орденскую крепость в Пруссии.
В связи с поражением гроссмейстера Тевтонского ордена в войне с Польшей ливонский магистр заявил об отделении Ливонского ордена.
Польше и в этот раз не удалось добиться полной ликвидации Тевтонского ордена — векового врага польского народа. Орден продолжал оставаться также вассалом германского императора и папы римского. Лихорадочные попытки орденских братьев получить помощь из стран Западной Европы, ликвидировать или ослабить результат Второго Торуньского мира и вернуть себе прежнее господствующее положение в Пруссии не увенчались успехом. Орден влачил жалкое существование — казна была пуста, войска не было, хозяйство приходило в упадок. Наконец, Орден нашел союзника и покровителя из немецкой княжеской фамилии Гогенцоллернов.
Альбрехт Гогенцоллерн Бранденбургский в 1511 г. был избран гроссмейстером Ордена. Он сразу же начал войну с Польшей, пытаясь вернуть потерянные территории Пруссии. Орден надеялся на помощь из Германии, но она оказалась недостаточной, и орденские войска потерпели поражение. Тогда Альбрехт воспользовался реформацией и решил захватить земли Ордена и церкви. Он отрекся от католичества и перешел в лютеранство.
В 1525 г. герцог Альбрехт объявил территорию Тевтонского ордена герцогством Прусским — своим наследственным феодальным владением — и стал вассалом польского короля.[40] Так оформилось Прусское государство — гнездо немецких феодальных баронов и оплот новых завоеваний. Военно-феодальное Прусское герцогство в 1618 г. объединилось с Бранденбургским маркграфством, где правила та же династия Гогенцоллернов. Еще через 80 лет Бранденбургское маркграфство превратилось в Прусское королевство (1701), ставшее вскоре одним из сильнейших агрессивных государств Европы. Вскоре Пруссия заняла господствующее место в Германии.
