Документы, приведенные в предыдущем разделе, дают ясно понять, что командование партизанами в этой части Брянской области находилось в руках Красной армии. Контроль НКВД, главным образом, имел отношение к безопасности, то есть к проверке лояльности и неукоснительного выполнения своих обязанностей командирами и рядовыми партизанами[62]. Подтверждением этому служит и заявление одного из дезертиров, который сообщил немцам, что в апреле 1942 года в районе действий его отряда появился офицер в форме НКВД, проводивший проверку благонадежности отдельных партизан. По приказам этого офицера НКВД два человека, ранее служившие в созданной немцами администрации, а затем призванные в партизаны, были расстреляны. Сам этот дезертир опасался, что могут всплыть некоторые неприглядные факты из его прошлого.
Работа по проверке благонадежности членов отрядов велась не только направляемыми извне сотрудниками НКВД, но и представителями этого ведомства внутри отрядов. Сообщения из других районов свидетельствуют, что к 1943 году в каждой бригаде при штабе существовал свой Особый отдел. Документов, которые подтверждали бы это, обнаружено не было, но вполне можно предположить, что в бригадах подобные органы имелись. Помимо этого, о существовании Особого отдела при штабе Южной оперативной группы сообщается в двух немецких донесениях от июня 1943 года.
