Снежно-белая жилетка Гелена вся покрылась грязными пятнами, когда «его» Федеральная разведывательная служба все больше попадала под политический огонь. Консервативный генерал-майор вел разведывательную работу под знаком антикоммунизма. Само собой разумеется, что вскоре под его лупу и в его досье попали и западные немцы, которых он подозревал в марксистских взглядах. Страстному разведчику против Востока не оставалось времени для изучения конституции ФРГ. Так как Гелен был в хороших отношениях с Аденауером и Ведомством Федерального канцлера, его служба еще пользовалась почтительным уважением, когда начали накапливаться неудачи.
Шпион ГДР Хайнц Фельфе в течение десяти лет работал в центральном бюро в Пуллахе. Фельфе принес Гелену и БНД в конечном счете больший ущерб, чем все остальные работавшие против них силы. Как и другие бывшие члены СС, Фельфе был завербован в Организацию Гелена одним из «старых товарищей». Никто, очевидно, не замечал того, что Фельфе при месячном жаловании в 1700 марок смог купить себе десятиквартирный дом за 100 тысяч марок и вести роскошный образ жизни. Быстрый взлет Фельфе в БНД, казалось, оправдывался его большими успехами: никто не разоблачил столько коммунистических агентов, как он. Пока Фельфе обманывал Гелена и американцев, он не забывал своей основной работы: он сфотографировал миникамерой «Минокс» и передал КГБ более 15 тысяч копий секретных документов. К выданным им сведениям относились списки агентов Гелена в ФРГ и за рубежом, тайные адреса информаторов, служебные сообщения о проводящихся операциях, отчеты о подслушивании ежемесячные отчеты по контрразведке. Разоблачение Фельфе 6 ноября 1961 года было тяжелым ударом не только для Гелена. Фельфе приговорили к 14 годам тюрьмы (а в феврале 1969 года обменяли на 21 западного агента).
1 мая 1968 года Гелен вышел на пенсию. Его преемнику Герхарду Весселю пришлось бороться с распространившейся дурной славой БНД, что она полна бывшими нацистами, стала оплотом Советского Союза и аморальным болотом. Так Вессель во второй раз стал преемником Гелена, ведь за 23 года до этого он принял у Гелена руководство отделом «Иностранных армий Востока», когда сам Гелен бежал в Альпы, чтобы с прихваченным с собой материалом дожидаться конца войны и прихода американцев.
Одно наследие Гелена и сейчас свойственно БНД: практиковавшееся им кумовство. Гелен устраивал на «своей» Службе сыновей, братьев, зятьев, шуринов и друзей, как и бывших сотрудников СС и СД, вроде Фельфе. БНД точно унаследовала эту традицию от Организации Гелена, что не очень позитивно отразилось на ее имидже. Кроме того, Гелен совершил ошибку, выплачивая деньги журналистам за блистательное изображение «его» Службы. Это не особо помогло, ведь Аденауер, например, не упомянул Гелена в своих воспоминаниях ни одним словом. Гелен однажды сам признал, что его резидент в Гамбурге получил задание получить запланированную журналом «Шпигель» к публикации статью, чтобы внести предложения об изменениях со стороны БНД.
