При переходе лодки в район дифферентовки в бухту Саранная продолжалось, уже в нарушение всех инструкций, вентилирование носовых отсеков в атмосферу, хотя после приготовления к походу и бою запоры общесудовой системы вентиляции должны быть уже на ручном управлении и стоять на стопорах. Сменился личный состав на боевых постах, после объявления учебной тревоги вентиляторы были остановлены, но 1 и 2 запоры вдувной магистрали остались открытыми, а транспаранты их положения в ЦП, ввиду поломки, естественно, не загорались.
В 23 часа 30 минут начали погружение, лодка перешла в позиционное положение (заполнены цистерны концевых групп)- но клапаны вентиляции цистерн средней группы не открывались ввиду срабатывания автоматики, которая реагировала на открытые забортные отверстия. По приказу командира БЧ-5 была отключена блокировка. К этому событию примешалось еще одно – оказались закрытыми)!) кингстоны глубиномера и в центральном посту не могли понять, почему лодка не погружается. Не став особенно разбираться, командир БЧ-5 приказал принять воду для утяжеления лодки в уравнительную цистерну.
И тут одновременно поступили два доклада: из ЦП – "Топ перископа – ноль" (перископ ушел в воду) и из четвертого отсека – "Поступление воды в отсек!"
На подводной лодке была объявлена аварийная тревога, командир БЧ-5 дал команду на продувание цистерн воздухом высокого давления (ВВД), но поскольку клапаны вентиляции и аварийные захлопки цистерн были открыты (шел процесс погружения), то воздух вытравился в море.
Погас свет, уже после подъема лодки было установлено, что оператор ГЭУ, который находился в 4 отсеке, успел сбросить аварийную защиту реактора и заглушить его всеми штатными поглотителями. Командиры дивизионов электротехнического и движения были обнаружены у 1 запора системы вентиляции, на привод которого был надет ключ- трещотка, но за те 30 секунд, что им было отведено, они не успели да и не смогли бы его перекрыть. Мичман В. Лещук (доложивший о поступлении воды) также был найден у люка, навалившимся на рычаг затвора.
Два молодых матроса, которые находились в верхнем помещении четвертого отсека, самовольно кинулись в корму, переборочную дверь в 5 отсек из-за поступающей воды они закрыть уже не смогли, в результате было затоплено и реакторное помещение.
После удара о грунт были вручную закрыты клапаны вентиляции, поданы остатки ВВД, лодка чуть подвсплыла и обратно легла на грунт на глубине 39 метров, с креном 15 градусов на левый борт и дифферентом на корму в полградуса. В затопленных помещениях погибло 14 человек. В носовых отсеках находилось 84 человека, в корме- 23.
