Конец периоду вынужденной самостоятельной законотворческой инициативы положило "Наставление по контрразведке в военное время" от 6 июня 1915 года, подписанное Верховным главнокомандующим. Согласно этому основополагающему документу, "общая цель контрразведки заключается в обнаружении, обследовании, разработке и ликвидации в кратчайший срок, как в районе, занятом нашими войсками, и их ближайшем тылу, так и вообще на территории государства, всякого рода шпионских организаций и агентов, тайно собирающих сведения о наших вооруженных силах и вообще всякого рода сведения военного характера, дабы воспрепятствовать этим организациям и агентам действовать нам во вред.
2. Каждый начальник должен всегда сам своими средствами принимать меры к тому, чтобы не допускать неприятеля разведывать о подчиненных ему войсках и об обстановке окружающей их, дабы обеспечить этим успешность выполнения боевых задач и безопасность вверенных ему войск".
Штаб Верховного главнокомандующего определен высшим органом, руководящим контрразведкой в империи. На местах же порядок определен следующий:
"Контрразведку организуют и ею руководят: а) в штабах фронтов, армий, входящих в состав фронтов и отдельных армий - генерал-квартирмейстеры, по общим указаниям начальников; б) в штабах военных округов на театре военных действий - начальники штабов; в) в штабах внутренних военных округов (вне театра военных действий) - генерал-квартирмейстеры по общим указаниям начальников штабов там, где должность генерал-квартирмейстера сохранена на время войны, а где нет генерал-квартирмейстеров - начальники штабов".
При штабах всех уровней, от Главного управления Генерального штаба до штаба армии, создавались контрразведывательные отделения, как специальные органы контрразведки. Зона ответственности соответствовала пределам войсковых районов.
Особого внимания заслуживает следующее положение, недостатки которого дадут знать о себе в скором времени: "Контрразведывательное отделение формируется и состоит при разведывательном отделении отдела генерал-квартирмейстера штаба армии. Начальник контрразведывательного отделения подчиняется начальнику разведывательного отделения". При этом подготовленные контрразведывательным отделением документы докладываются генерал-квартирмейстеру начальником разведывательного отделения. Аудиенция же у своего прямого начальника возможна была лишь в двух случаях: 1 - когда вызовет для более подробного доклада сам и 2 - по ходатайству начальника контрразведывательного отделения, но их беседа могла происходить только в присутствии начальника разведывательного отделения.
