Почти три первых года своего гетманства Брюховецкий провел в непрерывной войне с гетманом Павлом Тетерей, который сменил Хмельницкого на правой стороне Днепра, а также с поляками, которые поддерживали Тетерю. В то же время он безуспешно старался подчинить своей власти отдельные города и полки, находившиеся на правой стороне Днепра. В Левобережной Украине Брюховецкий далеко не оправдал надежд народа. Казненных или сосланных им старшин он заменил своими приближенными, проявившими страшное корыстолюбие. Сам Брюховецкий, опасаясь за прочность своей власти, постоянно прибегал к казням, ссылкам, конфискациям. Желая заручиться твердой поддержкой Москвы, Брюховецкий отправился туда в 1665 году с огромной свитой (более 500 человек); его ожидал теплый и радушный прием, сам он получил сан боярина, сопутствовавшие ему полковники — звание дворян, и все они — поместья; Брюховецкий тут же женился на москвичке (по одним сведениям — на дочери князя Дмитрия Долгорукого, по другим — на дочери боярина Федора Шереметева). Но Брюховецкий должен был отказаться от тех статей Переяславльского договора, которые обеспечивали административное и финансовое самоуправление Малороссии. Эти части управления Брюховецкий уступал московским воеводам, которые должны были принять в свое ведение малороссийские полковые города и поселиться в них с отрядами московского войска. В 1666 году состоялась передача всех полковых городов воеводам, начавшим перепись населения, наложение разных податей и налогов и т. д.
По возвращении из Москвы Брюховецкий окружил себя пышностью, сделался крайне надменным, стал удаляться от военных дел. Народное брожение против гетмана, полковников и воевод скоро стало повсеместным. Андрусовский договор объединил всех недовольных.
Видя шаткость своего положения и стремясь возвратить себе прежнюю популярность, Брюховецкий решился изменить Москве: в 1668 году он созвал преданных ему полковников в Гадяч на тайное совещание, на котором было решено поднять восстание против воевод.
Народ частично реализовал эту идею: воеводы были частью перебиты, частью изгнаны, но народного доверия Брюховецкий не вернул. Тогда он растерялся и стал искать помощи у крымского хана и турецкого султана. Высланные против Брюховецкого московские войска, под начальством князя Ромодановского, заняли два пограничных города — Котельву и Опошню.
С небольшим наемным отрядом Брюховецкий медленно пошел было навстречу Ромодановскому, но остановился близ села Диканьки, на урочище «Сербинское поле» и, вероятно, готов был сдаться.
