На основе разведывательной информации Генда заключил, что американские самолеты никогда не патрулируют северные районы Гавайев. Вероятность встретить в том районе американские корабли также была минимальной. Осенние и зимние туманы, которые накрывали Гавайи с севера и северо-востока, могли послужить отличным укрытием для японской эскадры. При этом американцы могли заметить японские корабли лишь в конце маршрута, уже в момент старта самолетов. Серьезную проблему представлял ограниченный запас топлива, пополнять который приходилось бы по дороге с помощью танкеров. Японские корабли не были приспособлены для столь дальних походов — политика императорской Японии не предполагала строительства кораблей с большим запасом хода. Генеральный штаб верил в повторение успеха Цусимы, когда война на море выигрывалась бы в одном генеральном сражении в непосредственной близости от Японии. Только семь кораблей могли пройти маршрут от залива Хитокаппу до острова Оаху. Это были авианосцы «Kara», «Секаку», «Дзуйкаку», линкоры «Хией» и «Кирисима», а также два тяжелых крейсера «Тоне» и «Чикума». Остальным кораблям требовалась дозаправка. В середине 1941 года легкий крейсер «Абукума» и несколько эсминцев проводили интенсивные учения по дозаправке в открытом море. Эсминцы отрабатывали дозаправку, швартуясь к левому или правому борту танкера, а также за его кормой. Авианосцы «Акаги», «Сорю» и «Хирю» должны были взять на борт дополнительный запас топлива в бочках, которые расставлялись по всем свободным участкам палуб. По соображениям остойчивости эсминцы сопровождения и легкий крейсер «Абукума» не могли взять дополнительный запас топлива. Поэтому план предусматривал одну дозаправку для авианосцев и две для кораблей сопровождения. Несмотря на высокую подготовку экипажей, большой фактор неопределенности вносила погода, из-за которой вся операция могла быть поставлена под вопрос.
До этого времени еще не был решен вопрос о том, как придется сбрасывать торпеды в высокие волны Перл-Харбора. Рапорты от офицеров, посетивших Трент, позволили начать работы в этом направлении. Арсенал в Йокосуке приступил к модернизации имеющихся торпед. Однако пробные сбросы торпед не принесли ожидаемых результатов. Торпеды зарывались слишком глубоко, и требовалось не менее 200 метров, чтобы торпеда вышла на боевую глубину. Таким образом, применять торпеды при налете на Перл-Харбор не было никакой возможности. Кроме того, американцы обычно швартовали корабли парами. Снаружи линкоры прикрывались менее крупными кораблями, поэтому были хорошо защищены от торпед. Единственной возможностью поразить линкор было использовать бронебойные бомбы. Из имевшихся в арсенале японской авиации бомб ни одна не могла подойти на эту роль.
