28 января 1918 года советская делегация, возглавляемая Л. Д. Троцким, отказалась от подписания мирного договора в Брест-Литовске, но одновременно было объявлено о демобилизации российских вооруженных сил. В этот же день в Финляндии вспыхнула гражданская война. Начались кровопролитные бои между «белыми» и «красными» финнами. Командующий Петроградским военным округом Н. И. Подвойский отдал распоряжение российским войскам придерживаться нейтралитета, но из Петрограда не могли в то время контролировать те или иные действия войск, а значительная часть 42-го корпуса поддержала «красных» финнов, овладевших южной частью страны со столицей Гельсингфорсом и объявивших о создании Финляндской советской рабочей республики.
Совет Народных Комиссаров декретом от 14 февраля 1918 года объявил о роспуске Российского флота и организации Красного флота, а 3 марта 1918 года Советская Россия подписала Брестский мирный договор, по условиям которого корабли, находящиеся в финских территориальных водах, должны были или разоружиться, или покинуть их. Положение серьезно осложняло то, что Финский залив был покрыт льдом и корабли в море выйти не могли.
Тем временем, правительство Финляндии в лице П. Э. Свинхувуда обратилось 7 марта 1918 года за военной помощью к Германии, где был сформирован экспедиционный корпус генерала Р. фон дер Гольца. Входившая в его состав так называемая «Балтийская дивизия», численностью 9500 человек, 3 апреля высадилась в порту Гангэ и двинулась маршем на Гельсингфорс, где базировалось ядро Красного Балтийского флота. Находившиеся в Гангэ подводные лодки АГ-11, АГ-12, АГ-15 и АГ-16 вместе с плавбазой «Оланд» были в тот же день взорваны своими экипажами, которые затем выехали в Гельсингфорс поездом.
13 апреля «Балтийская дивизия» вместе с «белыми» финнами взяла Гельсингфорс, но еще к 11 апреля основная часть кораблей Балтийского флота ушла в «Ледовый поход» к Кронштадту. Вооруженные силы Финляндии заняли оставленные русскими войсками военные объекты и оставшиеся в финских водах корабли. Для Ханко вновь настал мирный период, длившийся 20 лет.
Напряженность политической обстановки во второй половине 1930-х годов вызвала у руководства СССР интерес к возрождению как существовавших, так и остававшихся незавершенными объектов морской крепости Петра Великого; большая часть этих объектов оказалась на территории Финляндии и Эстонии. Советско-финская война и включение прибалтийских государств в состав СССР изменили это положение.
