В это же время черыре раза в месяц готовилось боевое расписание сил противника по фронтам и направлениям, в котором учитывалось нахождение каждой фашистской дивизии, каждой отдельной бригады, каждого полка и даже батальона.
По мере поступления сведений из зарубежных аппаратов по наиболее важным военным и военно-политическим вопросам в Разведуправлении Красной Армии готовились спецсообщения для членов ГКО.
Положение на фронтах Великой Отечественной войны было предельно сложным. Военная разведка, потерявшая в годы кадровой чистки опытных сотрудников, медленно восстанавливала свои силы и вступила в 1942 год не в самой лучшей боевой форме. В конце января 1942 года руководители военной разведки были вынуждены обратиться в ГКО с предложениями по улучшению структуры Разведуправления Красной Армии и приведении ее в соответствие с военной обстановкой.
В феврале 1942 года нарком обороны подписал приказ о реорганизации военной разведки. Было создано Главное разведывательное управление Генерального штаба Красной Армии. Начальником военной разведки был утвержден генерал-майор А. П. Панфилов. На должности военного комиссара ГРУ остался И. И. Ильичев.
В подчинении ГРУ ГШ оказались все силы военной разведки — зарубежной, оперативной и войсковой. Такая централизация оказалась малоэффективной. Она была не способна оперативно решать разведывательные задачи и в конце 1942 года вся система военной разведки вновь подверглась реорганизации. Структурные и кадровые изменения продолжались и в последующие годы.
Несмотря на сосредоточение всех сил военной разведки на добывании сведений, необходимых для ведения войны, и постоянные реорганизации она продолжала поиск данных о создании атомного оружия в Великобритании, Германии и США.
В годы Великой Отечественной войны в структуре ГРУ не было единого отдела, в котором бы сосредоточивались все сведения по атомной проблеме. Поступавшая из зарубежных резидентур информация накапливалась в линейных отделах и докладывалась начальнику управления, который определял, как и кому направить добытые сведения. Такой порядок учета и доведения до заинтересованных лиц информации по атомной проблеме был далек от совершенства. Однако все добытые сведения были своевременно учтены, оценены и переданы в заинтересованные государственные структуры.
Таганрогский трофей был не первым сигналом о том, что в Германии ведутся работы по исследованию возможностей получения энергии в результате цепной реакции в атомах урана. В январе 1942 года из резидентуры военной разведки в Лондоне в Центр поступила радиограмма, в которой говорилось о том, что немцы активно ведут переговоры в Португалии и Испании и пытаются «закупить уран для неизвестных целей». В донесении в Центр резидент военной разведки в Лондоне генерал-майор И. Скляров высказывал предположение: «Не связаны ли эти закупки с производством урановых бомб?»
