После того к Черепкову в кабинет и на квартиру нагрянули с обыском сотрудники УВД и в присутствии понятых изъяли все подаренное "Волковым". Обнаружена ими была и еще одна взятка, которую Черепкову за помощь в трудоустройстве дал второй агент милиции - "гражданин Чепкевич", ничего не ведавший о существовании "афганца Волкова" и действовавший отдельно от него.
По результатам операции началось следствие. Черепкову и шести его подчиненным предъявляли обвинение в получении взяток, и он указом Ельцина в начала 1994 года был освобожден от занимаемой должности.
Следствие шло своим ходом, и вдруг стали происходить странные необъяснимые события. Поздним вечером 25 марта 1995 года руководитель операции "Вирус" майор Владимир Дудин возвращался домой с малолетним сыном. У подъезда его встретили четверо неизвестных в камуфляжах, в масках, с оружием и, ничего не объясняя, избили, связали, запихнули в багажник машины, привезли в аэропорт и оттуда переправили в Москву - в тюрьму "Лефортово".
В Красноярском крае был задержан, также жестоко избит и потом доставлен в то же "Лефортово" агент милиции "гражданин Чепкевич". За решеткой оказались и "афганец Волков", и курировавший операцию "Вирус" генерал-майор Приморского УВД Александр Бондаренко.
Всем задержанным милиционерам с санкции Генерального прокурора Ильюшенко, который со временем сам попадет в "Лефортово", предъявили обвинения в "фальсификации дела о взятках во Владивостокской мэрии". Кто доказал Ильюшенко наличие фальсификации - неизвестно. Но почему милиционеров хватали без объяснений и били, им стало ясно сразу же.
Каждому из них в расчете на испуг было предложено: признайтесь, что вы совершили противоправные действия против сотрудников мэрии по указанию губернатора края Евгения Наздратенко, и вы сразу получите свободу.
Одновременно с участниками операции "Вирус" прокурорское ведомство проводило и соответствующую обработку свидетелей.
Из заявления понятого Павла Зубова: "По словам следователя прокуратуры Сидоренко, от меня требовалось, чтобы я показал, что на обыске у Черепкова оперуполномоченный УВД Приморского края Дудин подбросил деньги и что я якобы видел и заранее знал об этом факте.
Я категорически отказался давать ложные, не соответствующие действительности показания. После этого Сидоренко предложил мне подумать и ушел, закрыв меня в камере, где я просидел не менее двух часов. Потом он вернулся и сам стал писать протокол допросов, сам записывал вопросы и сам же давал на них ответы. Я отказался подписать написанный им протокол. Тогда Сидоренко сказал, что он оставляет меня в камере. Испугавшись реальных угроз, я подписал протокол".
