Спустя полгода после инцидента у следствия появился некий засекреченный свидетель, заявивший, что он видел расстрел на Смоленской набережной и даже запомнил марку и госномер автомобиля преступников. Вычислив таким образом водителя Хацуева, следствие в конце марта 2009 года установило скрытое наблюдение за ним и взяло под контроль звонки с его мобильного телефона.
К 7 апреля доказательства причастности чеченца к убийству Руслана Ямадаева, с точки зрения следствия, были собраны, и его задержали. При обыске у Хацуева нашли пистолет Макарова, не имеющий отношения к убийству.
В результате отработки личных и телефонных контактов Хацуева следствие заинтересовалось его приятелями Асланбеком Дадаевым и Тимуром Исаевым. Следователи обратили внимание на некоторые фразы в их телефонных переговорах, например: «Он сам открыл окно. Не надо было так много курить».
Разговор в данном случае, по мнению оперативников, мог идти о вредной привычке генерала Кизюна, благодаря которой киллеру и удалось расстрелять обоих пассажиров бронированного автомобиля.
В разговорах приятелей Хацуева следователей заинтересовали и явные намеки на другое громкое преступление — покушение на главу финансово-промышленного холдинга «Конверс груп» Сергея Антонова, обстрелянного из пистолета-пулемета 11 марта в Москве. В банкира попало пять пуль, причинив неопасные для жизни ранения. Еще две пули угодили в ноги охраннику банкира Александру Комарову, успевшему повалить шефа и отчасти прикрыть его своим телом.
Дадаева и Исаева арестовали поздно вечером 7 апреля. На следующий день нападавших на Антонова опознал его легкораненый охранник. По его словам, Тимур Исаев стрелял в его шефа с пассажирского сиденья автомобиля, а Асланбек Дадаев сидел за рулем.
По результатам опознания обоим чеченцам предъявили обвинения в покушении на убийство Сергея Антонова.
После этого следователи предъявили Дадаева и Исаева для опознания генералу Кизюну. Тот заявил, что в него через приоткрытое стекло «мерседеса» стрелял Асланбек Дадаев. Однако защитники чеченца тут же опротестовали это следственное действие, поскольку, по словам адвоката, достоверно установлено, что преступник был в черной матерчатой маске с прорезями для глаз.
Адвокат полагает, что опознать киллера «по глазам» невозможно. Пока следствие не стало предъявлять Дадаеву и Исаеву обвинения в убийстве Руслана Ямадаева: речь идет лишь о том, что эти двое «могут быть причастны» и к расстрелу на Смоленской набережной.
