В устье Ла-Платы Дарвин снова съехал на берег и совершил за 10 недель две поездки в пампасы на 70 миль от берега. В районе Ла-Платы исследователь собрал более 1600 видов растений, насекомых, птиц и животных. Часть добытых экспонатов, тщательно упакованных в бутылки и банки, Дарвин отправлял с английскими кораблями в Лондон, а те, что не удавалось отправить, хранил у себя в каюте.
Говоря о напряженной и самоотверженной работе молодого натуралиста "Вигла", нельзя не сказать, что его жизнь на борту корабля омрачалась не только морской болезнью, приступами тропической лихорадки, но и личными отношениями с капитаном корвета. Большинство английских историков флота, отдавая дань Роберту Фицрою как выдающемуся моряку, известному гидрографу, метеорологу и позже вице-адмиралу Британского флота, члену английского парламента и губернатору Новой Зеландии, отмечают его крутой нрав и вспыльчивый характер. Некоторые исследователи даже считают его не совсем нормальным. При этом они ссылаются на следующий факт. Известно, что Фицрой организовал в Великобритании регулярную, метеорологическую службу. По разработанной им методике делались прогнозы погоды, В 1865 году, когда его прогноз погоды оказался ошибочным, вицеадмирал Фицрой бритвой перерезал себе горло. Отношения Чарлза Дарвина с командиром "Вигла" почти в течение пяти лет совместного плавания были весьма натянутыми. Дарвин и Фицрой оказались во всех отношениях абсолютно разными людьми - по своему темпераменту, характеру, политическим взглядам и религиозным мировоззрениям.
Во время пятилетнего плавания корвет выдержал немало сильных штормов и показал отличные мореходные качества. Фактически он потерпел лишь одну аварию, ударившись блиа порта Дезайр днищем о подводную скалу и сорвав часть фальшкиля.
После тяжелого плавания вокруг мыса Горн 22 июля 1834 года избитый штормами "Вигл" вошел в гавань Вальпараисо, откуда Дарвин совершил полуторамесячное путешествие в Кордильеры.
Судя по дневникам, самое сильное впечатление за время этого длительного и интересного плавания на Дарвина произвели Галапагосские острова с их уникальным животным миром. Он очень сожалел, что Фицрой снялся с этих островов столь быстро.
Спустя 25 дней, подгоняемый мощным пассатом и показывая на лаге почти десять узлов, "Бигл" прошел в Тихом океане 3200 миль и 15 ноября 1835 года подошел к острову Таити.
Потом он побывал на Северном острове Новой Зеландии, где Дарвину довелось увидеть скелет доисторической птицы моа.
