Часто щенки попадают к владельцам, не понимающим важности племенной работы: собак не выставляют, не дрессируют. Если и с собакой европейской породы все эти мероприятия осуществлять нелегко, то среднеазиатская овчарка требует значительно больших усилий и настойчивости. Соответственно клуб служебного собаководства не имеет права включать таких животных в план разведения и получать от них потомство. И без того малочисленное поголовье племенных животных из-за этих причин становится еще меньше, утрачивается ценный племенной материал. Если бы на протяжении всех, этих лет он реализовывался полнее, группа животных, несущих крови Алтая, была бы значительно больше. Отрицательно сказывается на работе и постоянная смена общественников, руководящих разведением этой породы.
С конца 1985 года приказом начальника клуба служебного собаководства комитета ДОСААФ С.-Петербурга и области руководителем разведения породы среднеазиатская овчарка назначена М.Г. Мазурина, кандидат ветеринарных наук, человек, любящий и знающий породу, видевший начало ее становления в С.-Петербурге. Собаководы ставят своей целью сохранение в породе всего лучшего, что внес в нее Алтай. Работать приходится с очень трудных условиях. С одной стороны, они вызваны внутренними причинами — широким распространением кровей Бекира и Аждара, в свое время перекрывших почти все поголовье сук, в результате чего при подборе пар все время возникают сопутствующие нежелательные инбридинги. С другой стороны, имеются серьезные внешние причины. В последние годы в С.-Петербурге и других городах образовались многочисленные любительские объединения собаководов, которые занимаются разведением, в том числе и среднеазиатской овчарки. В этих объединениях к племенной работе с породами не относятся столь строго и ответственно, как это принято в клубах служебного собаководства ДОСААФ. Происходит утечка членов клуба служебного собаководства ДОСААФ и перераспределение поголовья собак по самым разным собаководческим объединениям. И без того малочисленное поголовье среднеазиатских овчарок дробится еще более. Но самое главное, теряется общая направленность селекции, нарушается единый подход к отбору животных на племя и к подбору пар. Такое положение, напоминающее ситуацию известной басни Крылова, только вредит делу.
Очень мешает работе практически неконтролируемый ввоз собак из Средней Азии, часто весьма сомнительного происхождения, с наличием в родословной двух рядов предков, клички которых ничего не говорят специалистам. Завозить среднеазиатских овчарок нужно целенаправленно, из хозяйств, где разведение этой породы ведется на достаточно высоком уровне длительное время. Крайне необходимо, чтобы у всех собак, допущенных в разведение, была бы полная четырехколенная родословная. В противном случае порода еще долготе выйдет из стадии переходной.
