Местное население на Кавказе и в Средней Азии никогда не оставляет под сукой всех родившихся щенков. Отбор производится на 7-8-й день, чтобы щенки успели разработать у суки соски и как следует раздоить ее. К этому же времени происходит естественное отставание в росте слабейших щенков и их становится легко отбраковать.
Отбракованные щенки уничтожаются.
Щенков чабаны отдают преимущественно родственникам или близким друзьям, поэтому оставляют в живых наиболее сильных и энергичных, лучших щенков помета.
Еще в 30-е годы раздавались голоса о бедственном состоянии аборигенных овчарок Кавказа и Средней Азии.
В 1934 году Кошелев и Тимашук в работе «Пастушье-сторожевые собаки в совхозах Северо-Кавказского края и собаководство Армении» писали: «Печальную картину представляет собой дело разведения собак. Сук и молодняка почти нет. Некоторые селения, не говоря уже о колхозах, не имеют ни одной суки. Большинство собак 5-7-летнего возраста.
По своим экстерьерным качествам собаки представляют собой бракованный материал. Армения до сих пор являлась базой бесконечных заготовок и вывоза собак главным образом по линии ведомств. В результате этой работы ценное собачье хозяйство многих районов Армении совершенно разорено. Если раньше высота кавказской овчарки достигала 70 см, то теперь высота большинства собак равна 55 см».
Надеяться на то, что в наше время состояние породы в исконных районах обитания улучшилось, не приходится. Скорее, наоборот. Продолжается изъятие поголовья в другие районы страны и даже за границу. Разведение породы и ее судьба находятся в руках лишь небольшого числа энтузиастов-чабанов.
В связи с прогрессом и освоением труднодоступных районов Кавказа, развитием массового туризма, горнолыжного и альпинистского спорта, а также широким народнохозяйственным использованием заповедных уголков природы в последние годы возникла реальная угроза метизации этой ценнейшей породы. В указанные районы завозятся собаки других пород, особенно немецкие овчарки. В горно-спасательной службе широко используются лайки, колли. Встречаются и другие породы.
Так, например, из разговора с работниками высокогорного заповедника Кабардино-Балкарии стало известно, что у местного чабана кроме кавказских овчарок отару охраняет черный терьер, выбракованный из армейского питомника.
А в близлежащем поселке живет высокопородная немецкая овчарка. Помимо собак культурных пород в подобных селениях встречаются и некрупные беспородные собаки.
