11 ноября 1963 года разозлившиеся офицеры выслали начальника Национальной гвардии за границу. Его просто посадили в самолет, вылетавший в Мадрид, причем без паспорта.
Баасисты пытались сопротивляться, но не могли противостоять армии.
18 ноября власть перешла к военной хунте во главе с Абд-аль Салямом Арефом. Ареф выкинул руководителей БААС из правительства, а офицеров-баасистов — из армии. Устав от партийных раздоров, Ареф распустил все политические партии, а себя сделал президентом страны.
Сирийские баасисты были огорчены поражением товарищей по партии. Но сделать ничего не могли.
Саддам Хусейн смог вернуться на родину после убийства Касема. Он увидел, что вся власть и все должности в Ираке (как в Египте и Сирии) оказалась в руках военных. Саддам никогда не служил в армии, он был штатским и потому вынужденно сделал ставку на партийную карьеру.
Он очень понравился основателю партии БААС Мишелю Афляку, который сформулировал принцип, столь милый сердцу Саддама: «Идеи не существуют сами по себе, они живут в головах людей, поэтому окончательно устранить их можно только одним способом: физически устраняя носителей этих идей».
Когда генерал Ареф разогнал баасистов, Саддам постоянно ездил в Дамаск, где находилось руководство партии. Он убедил старших товарищей сформировать новое региональное руководство партии БААС. Его возглавил иракский генерал Ахмад Хасан аль-Бакр. В состав руководства включили и молодого, но очень активного человека по имени Саддам Хусейн аль-Тикрити.
В 1964 году баасисты попытались совершить переворот и убить Арефа. План провалился. Ареф запретил партию. Но военные проявили неслыханный для Ирака либерализм. Вместо того чтобы расстрелять или повесить своих врагов, видных баасистов, в том числе Ахмада Хасана аль-Бакра и Саддама Хусейна, их всего лишь посадили в тюрьму. Через два года им организовали побег.
13 апреля 1966 года Ареф погиб в авиационной катастрофе. Новым главой государства стал его младший брат, начальник генерального штаба генерал-майор Абд-аль Рахман Ареф, не самый популярный среди иракских военных.
В сентябре 1966 года активисты БААС провели подпольный партийный съезд. Секретарем партии стал аль-Бакр, его заместителем — Саддам Хусейн. Причем генерал охотно переложил на своего молодого помощника (Саддам был моложе на двадцать пять лет) все внутрипартийные дела.
Саддам с присущей ему энергией быстро создавал партийный аппарат, подбирая людей, которые по существу присягали на верность лично ему.
