В 1859 г. вражда между Бахрейном и ваххабитами вспыхнула вновь. Причиной ее стало то, что в ответ на действия против семейства Аль Халифа мятежного Мубарака ибн ‘Абд Аллаха Аль Халифы, принятого ваххабитами в Даммаме, эмир Бахрейна перестал платить им дань. Более того, подбил катарские племена, признававшие его сюзеренетет, на смуту против «власти недждийцев». Правитель Эль-Катифа, подвластного тогда ваххабитам, и Мубарак ибн ‘Абд Аллах Аль Халифа приступили к подготовке набега на Бахрейн, которым стал угрожать роду Аль Халифа шейх ‘Абд Аллах, сын эмира Файсала и его наследник.
В дело вмешались англичане. Отправили к побережью Бахрейна военную эскадру; и угрозу захвата ваххабитами Бахрейна устранили, атаку, организованную ими, отбили. Затем, совместно с шейхом Мухаммадом ибн Халифой, заняли на какое-то время порт Даммам (5).
Ситуация вновь обострилась в мае 1860 года. Шейх ‘Абд Аллах ибн Файсал, наследный принц второго государства Сау’дов, пригрозил роду Аль Халифа, что заберет в свои руки все подвластные Бахрейну земли на побережье Катара, и будет удерживать их за собой, несмотря на возражения англичан, до тех пор, пока Манама не возобновит выплату дани Эр-Рияду.
С учетом всех угроз и враждебных действий ваххабитов в отношении рода Аль Халифа и его владений на Бахрейне и в Катаре, эмир Бахрейна, шейх Мухаммад, признанный уже англичанами независимым правителем, подписал в Манаме с британским политическим резидентом в Персидском заливе конвенцию о «вечном мире и дружбе» Бахрейна с Британской империей. Произошло это в конце января 1861 года. В ней подтверждались все обязательства по ранее заключенным Бахрейном договором и соглашениям с Англией, в том числе от 1820 г. (Генеральный договор о мире), 1835 г. (Первое морское соглашение), 1847 и 1856 гг. (о борьбе с работорговлей). Помимо этого, шейх Бахрейна обязался не принимать участия в междоусобицах арабов Прибрежной Аравии. Конвенция 1861 г. провозглашала приоритет Англии во внешней торговле Бахрейна и декларировала ее право на самостоятельную эксплуатацию жемчужных отмелей. Британцы, со своей стороны, подтверждали готовность оказывать Бахрейну помощь в защите от любой «внешней угрозы». Иными словами, в 1861 г. Бахрейн подпал под протекторат Британской империи де-факто. Ратификация конвенции английскими колониальными властями в Индии состоялась в феврале 1862 г. (6).
В 1863 г. возник бахрейнско-катарский конфликт по вопросу о первенстве родов Аль Халифа и Аль Тани среди катарских племен. Дж. Пэлгрев, именитый путешественник-исследователь Аравии, посещавший Катар в 1862 г., высказывался о шейхе Мухаммаде ибн Тани как о лидере жителей полуострова Катар, признанном в качестве такового всеми обитавшими там племенами. В апреле 1863 г. шейх Бахрейна предпринял репрессивные действия в отношении подвластной ему тогда Эль-Вакры — в наказание за связи с ваххабитами и изъявление подчиненности клану Аль Тани. Главу города, шейха Мухаммад Бу Кувара, повелел взять под стражу. После этого значительная часть населения Эль-Вакры дома свои покинула и перебралась на жительство в другие места.
