Так одновременно на многих поприщах подвизался отец Философ во имя спасения малого стада Христова, не жалея сил, не считая времени. Самое поразительное было в том, что он все, абсолютно все, данное ему в послушание от Господа, успевал сделать вовремя и добросовестно. Однако, подобно своему учителю, о. Иоанну Кронштадтскому, ничего не приписывал себе, своей личности, своим достоинствам. По воспоминаниям Веры Философовны Орнатской, смирение и кротость были отличительнейшими качествами выдающегося петербургского пастыря. Как и отец Иоанн, он часто говорил: «Сам я – ничто, благодать Христова, сила Божия действует через немощь мою и недостоинство…»
Вечером 6 октября 1913 года православный Петербург облетела весть о внезапной кончине настоятеля Казанского собора, протоиерея Николая Николаевича Головина, достойнейшего, редкой души пастыря, большого друга отца Философа Орнатского. Почившему было всего 63 года.
Через три дня в газетах появилось сообщение, вызвавшее одобрение у всех верующих столицы: «Предложением высокопреосвященного митрополита Петербургского Владимира, с Высочайшего Его Императорского Величества соизволения, на освободившуюся должность настоятеля Казанского собора назначен один из самых популярных в столице пастырей, известный церковный деятель и оратор, настоятель церкви святого Андрея Критского при Экспедиции Заготовления Государственных Бумаг, митрофорный протоиерей Философ Николаевич Орнатский» (155).
Новое послушание «один из самых популярных в столице пастырей» принял со свойственным ему смирением. Получив из прибылей Экспедиции пособие в 1000 рублей для переезда на новую квартиру (156), батюшка быстро собрался и уже 10 октября 1913 года приступил к служению на новом месте (157).
Казанский собор пользовался особой известностью не только в Санкт-Петербурге, но и во всей России. В нем находился знаменитый список с чудотворной Казанской иконы Божией Матери – самый чтимый в столице образ Пресвятой Богородицы. Собор был храмом-памятником Отечественной войне 1812 года, который стремились посетить все, приезжавшие в Петербург люди. Среди прихожан Казанского собора были многие представители высшей столичной знати. Очень часто посещали его члены Августейшей Фамилии – в храме было устроено особое Царское место, изготовленное из финского гранита. В день храмового праздника 8 июля собор не вмещал множества богомольцев, и молебен перед чудотворной Казанской иконой Божией Матери служили на помосте, на площади перед собором. Причт собора состоял из 6-ти протоиереев и 4-х священников. Старостой прихода был генерал-лейтенант, граф Николай Федорович Гейден, пожизненный член Общества распространения религиозно-нравственного просвещения в духе Православной Церкви.
