В 1921 году Борис Сергеевич переходит в московскую отоларингологическую клинику, руководимую профессором Л. И. Свержевским. Здесь были все условия для творческой работы.
Молодого врача интересует влияние солей тяжелых металлов на слуховой аппарат. Наблюдения показали, что у работников типографий, у тех, кто в силу своей профессии имеет дело со свинцом, ртутью, серебром, ухудшается слух. Проведенные исследования дали возможность разработать эффективную профилактику такого заболевания.
Жизнь подсказала новую тему исследований — взаимоотношения между спинномозговой жидкостью и жидкостью в так называемых лабиринтах ушей. Оказывается, тут есть своя закономерность: при повышении внутричерепного давления всегда страдает орган слуха. Врачам удавалось достигать хорошего лечебного эффекта при негнойных ушных заболеваниях, выводя из организма некоторое количество спинномозговой жидкости и тем самым снижая давление. Это важное исследование было положено в основу докторской диссертации Б. С. Преображенского, которую он защитил в 1926 году.
Особенно интересной оказалась работа о роли сотрясения тела человека в развитии тугоухости и глухоты. Как доказать, что во многих случаях понижение слуха вызывается именно длительным воздействием сотрясения на организм?
— В тридцатых годах в Москве почти все мостовые были покрыты булыжником, — рассказывает Борис Сергеевич. — Вот и решили проводить опыты на белых мышах, возя их в автобусе по улицам столицы. Мы заказали специальные ящики, и в них наши подопытные зверьки катались «зайцами» целыми днями. Не обошлось и без курьезов. Однажды пассажиры автобуса потребовали высадить «сумасшедшего, который возит зверей», и провести в салоне автобуса дезинфекцию. Но все окончилось благополучно. Опыты над мышами помогли в поисках средств, снижающих вредное воздействие сотрясения и вибрации на организм человека.
В 1936 году Борис Сергеевич избирается профессором, заведующим кафедрой болезней уха, горла и носа вновь созданного III Московского медицинского института. С 1941 года он заведует кафедрой оториноларингологии II Московского медицинского института.
Во время Великой Отечественной войны профессор Преображенский — главный отоларинголог. Народного комиссариата здравоохранения СССР. Он не только лечит и оперирует, но по-прежнему наблюдает и изучает. Свои наблюдения и выводы он обобщает в монографиях о лечении раненых с повреждениями уха, горла и носа, о хроническом тонзиллите, об ошибках в диагностике ангин. В содружестве с другими авторами Борис Сергеевич пишет ряд руководств и учебников, а также историю оториноларингологии, начиная с 1708 года.
