Лишь после Великого Октября перед Константином Ивановичем открылось широкое поле деятельности.
В 1920 году он переезжает в Москву, где избирается заведующим кафедрой паразитологии Московского ветеринарного института. Через год Константин Иванович возглавляет гельминтологический отдел Тропического института, ныне Института медицинской паразитологии и тропической медицины имени Е. И. Марциновского. С этого времени начинается многогранная деятельность Константина Ивановича как организатора советской гельминтологической науки.
Прежде всего необходимо было подготовить кадры квалифицированных гельминтологов, и Константин Иванович читает лекции, выступает с докладами, пишет статьи для научных и научно-популярных журналов. Число его учеников непрерывно росло. Если в 1918 году в Советском Союзе был только один специалист-гельминтолог — сам Константин Иванович, то теперь их насчитывается более полутора тысяч. К. И. Скрябин создал школу советских гельминтологов, нуда входят и биологи, и врачи, и ветеринары, и агрономы. Создав армию квалифицированных специалистов, Константин Иванович поставил задачу дегельминтизации, то есть не только изгнания паразитов из организма человека и животных, но и обеззараживания жилищ, почвы, воды от червей-паразитов, их яиц и личинок.
Где, в каких районах нашей страны распространены гельминты, где искать очаги вызванных ими болезней? Чтобы ответить на эти вопросы, необходимо было изучить гельминтофауну нашей страны, создать специальную карту. Так возникла идея гельминтологических разведок. Более трехсот экспедиций совершили ученики и сотрудники К. И. Скрябина. В ряде из них участвовал и он сам. Ученые побывали в Донбассе и на Дальнем Востоке, в Средней Азии и на Сахалине, на Урале и в Белоруссии. И всюду, нуда ни приезжали гельминтологи, они поднимали население на борьбу с червями-паразитами, подсказывали животноводам пути оздоровления скота, помогали местным специалистам повышать свои знания.
К. И. Скрябин открыл и описал около 200 неизвестных ранее видов червей-паразитов, выдвинул новые принципы борьбы с гельминтозами. Он опубликовал более 600 научных работ и среди них двадцатитрехтомную монографию «Трематоды животных и человека», обогатившую не только советскую, но и мировую науку.
Трудно переоценить значение борьбы с гельминтами, проводившейся во всех республиках нашей страны по единому, разработанному под руководством К. И. Скрябина плану.
Ушла, например, в прошлое тяжелая болезнь, поражавшая население старой Бухары, — ришта, вызываемая червем риштой. Все меньше и меньше людей страдает от заболеваний, вызываемых анкилостомами, аскаридами, свиным и бычьим цепнями, эхинококком.
