Разрабатываются методы прогноза режима и химического состава грунтовых вод на больших территориях, прогнозы уровней и влияния новых водохранилищ на прилегающую сушу, прогнозы режимов рек и балансов Аральского и Каспийского морей, прогнозы климатических изменений, сейсмической обстановки и т. д. Прогноз уровня Аральского и Каспийского морей — один из крупнейших научных вопросов, над которым работают многие ученые и проектировщики. Эта проблема затрагивает разнообразные интересы хозяйства. Уровень Каспийского моря за последний геологический период понизился. Есть предложения создать мощные дамбы с целью сохранить уровень вод Северного Каспия, чтобы сохранить его рыбные богатства. Иное положение с Аральским морем, которое за последний геологический период повышает свой уровень.
Большое место в научной работе занимают вопросы сейсмики, т. е. прогнозы землетрясений. Часть южных районов Туркмении находится в зоне, подверженной землетрясениям. Однако опасность и сила землетрясений быстро уменьшаются по направлению к востоку и северу. Проблема районирования возможности землетрясений включена в план работ в помощь Главному Туркменскому каналу, что поможет решению задачи окончательного трассирования канала.
Начаты большие и разнообразные работы по антисейсмическому строительству в городах и при постройке гидротехнических сооружений.
Особое место занимает проблематика, связанная с солями. Территория Прикаспийской низменности — бессточная пустыня — широко подвержена процессам современного природного засоления. Здесь почти на каждом шагу можно встретить соляные озера типа Эльтона и Баскунчака, сухие соляные скопления, соляные грязи.
В недрах земной коры здесь можно обнаружить так называемые соляные куполы. Это гигантские, часто величиною в несколько километров, скопления чистой каменной соли, которая выдавливается геологическими силами в земной коре к поверхности и иной раз прорывает земную кору в виде соляной горы. В Прикаспии такого рода скрытых подземных соляных куполов в среднем приходится по одному на каждые 300 км. Состоящие из чистой каменной соли соляные куполы отдают большое количество соли в грунт и вызывают сильное засоление окружающей местности.
Возникает ряд вопросов, на которые должны ответить ученые. Нужно ли при трассировании больших каналов обходить местоположение соляных куполов с тем, чтобы ложе канала не подвергалось деформации и в воду не попадали вредные соли? Как использовать соляные месторождения Прикаспия в интересах химической промышленности?
