— в силу зависимости кодирующего гена от «генетической среды» и возможности других сдвигов в генотипе, например при сплайсинге, вторичных (посттрансляционных) модификаций и т. д., белковый маркер несет более богатую генетическую информацию, чем кодирующий его ген;
— в главном потоке генетической информации белок — начало и основа метаболизма и морфогенеза, поэтому он самый надежный критерий в оценке функционального значения его маркирующего гена.
Разумеется, больших преимуществ следует ожидать от сочетания методов белковых маркеров с методами ДНК-маркирования.
Естественно, большую роль в молекулярно-биологическом анализе растений на основе использования белковых маркеров сыграли принципы и методы их электрофоретического разделения. В сочетании с другими методами биохимического и молекулярно-биологического (спектрального, люминесцентного, иммунохимического, цитохимического) анализа они позволили решить ряд важных задач прикладной ботаники, генетики и селекции. Как оказалось, многие из них могут быть успешно решены только с привлечением белковых маркеров. Так, например, только по электрофоретическим спектрам полиморфных белков возможен анализ морфологически однородных популяций. Только белковые маркеры позволяют исключать гетерозиготные растения на первых этапах семеноводства и сохранять характерные для сорта соотношения морфологически неразличимых генотипов в популяциях, что особенно важно при ускоренном способе выращивания элиты для быстрейшего внедрения в производство новых районированных и дефицитных сортов.
Пока только по белковым маркерам возможна прямая оценка семян на гибридность F.^ в семеноводстве гетерозисных гибридов, полностью заменяющая дорогостоящий, трудоемкий и малоэффективный грунт-контроль.
В настоящее время складываются технологии выделения биотипов и сортов самоопыляющихся культур и получения инбредных линий из сортовых популяций перекрестников на основе электрофоретического анализа маркерных белков единичных зерновок с сохранением их жизнеспособности. Как элемент селекционного процесса эта технология должна занять достойное место в ряду современных вспомогательных средств селекции. Ее преимущества, например перед клеточной селекцией или методами дигаплоидов в получении инбредных линий, состоят прежде всего в том, что, во-первых, селекционер здесь работает с нормальными, естественными, стабильными (неповрежденными) генетическими системами, во-вторых, он имеет возможность контролировать селекционный процесс и использовать в селекции весь генофонд сорта, популяции или вида в целом.
