Позднее Иван Грозный сделал Борисоглебский монастырь ссыльным местом. Сюда ссылались люди, неугодные его политике, не желавшие подчиняться его порядкам. Их насильно постригали, а имения передавались монастырю. Отсюда и огромные земельные богатства монастыря.
Уходили сюда на покой и добровольно, нередко - люди военные, одинокие; были, возможно, среди них и знатоки строительного дела. Здесь они не сидели сложа руки, по-видимому, находили себе применение в строительстве и строили вопреки строгим канонам церкви, по-своему применяясь к хозяйственным и военным нуждам.
Польская интервенция в нашем крае
Тяжелые годы переживала наша Родина в начале XVII века, во время польско-литовской интервенции.
Пали многие города, в том числе Ярославль, Переславль, Углич, Ростов. Не прошли эти события бесследно и для нашего района. В Борисоглебском, богатом хлебом районе расквартировано было около 20 польских отрядов. Более чем за два года многие селения были разграблены и выжжены дотла. Люди переселились в другие места, и их бывшие селения и пашни поросли лесом. Борисоглебский монастырь находился в осаде. Сюда была подтянута польская артиллерия и установлена на отрогах гор и на возвышенностях. Места эти получили название «Пановых гор», «Сапегиной горы» (народ переименовал ее в «гору Сипягину»). Селения, где долгое время квартировали сборщики продовольствия, тоже получили польские названия: «Веска», «Ляхово». Названия деревень «Паникарово», «Трепарево», «Душилово» рассказывают, как расправилось крестьянское население с польскими интервентами: оттрепали, задушили, а потом еще панов и покарали (Паникарово). Народное предание доносит до нас еще и такие сказы: когда польские полчища были изгнаны из нашего края, здесь кое-где еще бродили одинокие и голодные поляки, заходили в дома и просили есть. Одна крестьянка, приготовившая своей голодной семье завтрак, сварив из последней муки кисель, не накормив семьи, вылила его на голову врагу кипящим.
Борисоглеб дал Родине своих героев: келарь Троице-Сергиевой лавры Авраамий Палицын, родившийся в 1588 году в деревне Про-тасьево Борисоглебского района, в 1612 году активно содействовал победе ополчения Минина и Пожарского над польско-шведскими интервентами, организовал активную оборону Троицкого монастыря, написал «Сказание» об осаде лавры; монах Иринарх, родом из деревни Кондаково Борисоглебской волости, призывал народ в ополчение Минина и Пожарского.
