На суде Александр Ульянов говорил, что среди русского народа всегда найдутся люди, «которые настолько преданы своим идеям и настолько горячо чувствуют несчастье своей родины, что для них не составляет жертвы умереть за свое дело. Таких людей нельзя запугать чем-нибудь».
8 мая 1887 года Александр Ульянов и четверо его товарищей были казнены в Шлиссельбургской крепости.
Отвергая террор как метод борьбы, критикуя взгляды народников, В. И. Ленин высоко ценил революционность и героизм передовых русских интеллигентов: «Они проявили величайшее самопожертвование и своим героическим террористическим методом борьбы вызвали удивление всего мира»1. [1 В. И. Ленин. Полн. собр. соч., т. 30, стр. 315.]
В конце XIX века на активную борьбу с самодержавием и капитализмом поднимается пролетариат. История Петропавловской крепости по-своему отразила и этот, третий, этап развития освободительного движения в России.
Еще в 1879 году в тюрьму Трубецкого бастиона был брошен один из организаторов «Северного союза русских рабочих» В. П. Обнорский.
В 1894 - 1895 годах в крепости в заключении находились революционеры-марксисты П. А. Красиков, А. М. Лежава, М. С. Ольминский. Всем им царизм предъявил обвинение в пропаганде марксизма.
В 1896 - 1898 годах среди заключенных были ученики и соратники В. И. Ленина по «Союзу борьбы за освобождение рабочего класса» Ф. В. Ленгник, М. А. Сильвин, А. С. Шаповалов. Вместе с ними в крепость был брошен и Н. Э. Бауман. 22 месяца заключения в каземате крепостной тюрьмы не сломили его революционный дух. В камере Николай Эрнестович Бауман писал: «Я выступил на поле сражения, твердо надеясь вести победоносную борьбу».
В 1901 году в тюрьму Трубецкого бастиона попали первые «искровцы». За распространение общерусской марксистской газеты были арестованы и брошены в застенки крепости В. П. Ногин, П. К. Флегонтов и другие. В 1902 году в крепость был заключен член Организационного комитета по созыву II съезда РСДРП П. Н. Лепешинский.
После Кровавого воскресенья 9 января 1905 года все застенки Петропавловской крепости были заполнены участниками мирной демонстрации петербургских рабочих. В крепость заключили даже членов депутации, накануне посетившей министра внутренних дел с. целью предотвратить расстрел рабочих.
11 января 1905 года за воззвание по поводу событий 9 января «Ко всем русским гражданам и общественному мнению европейских государств» был арестован и заключен в тюрьму Трубецкого бастиона великий пролетарский писатель Алексей Максимович Горький. В Петропавловской крепости Горький пробыл месяц и 11 дней; здесь он написал пьесу «Дети солнца».
