В стенах Лавры происходит возмужание Василия Дроздова. Блестящие способности скоро выдвигают юношу в число лучших учащихся. В 1803 году его поставляют учителем в Семинарии. Необычайная острота ума, редкостная память, неустанное стремление к знаниям обещают в нем замечательного работника на ниве духовного просвещения. Строго аскетическая и целомудренная жизнь предвещает церковное служение. Открывшийся дар слова сулит выдающегося проповедника. Митрополит Платон, прозревая в молодом учителе будущего великого деятеля Церкви, предлагает ему принять иноческий сан, но Василий решается на это не сразу, а лишь после длительного обдумывания и пламенных молитв к Преподобному Сергию.
Шестнадцатого ноября 1808 года состоялось пострижение Василия Дроздова в монашество с именем Филарета в память святого Филарета Милостивого. (Нельзя не отметить, что во всем дальнейшем служении Святителя с очевидностью проявлялось и такое его качество, как милостивость, но – не угождение слабостям людским, а искренняя любовь к людям и помощь в деле спасения души человеческой.) Спустя пять дней инок Филарет был посвящен в сан иеродиакона. Казалось бы, судьба определилась, однако Провидение уготовало молодому монаху иное поприще. По указу Святейшего Синода иеродиакон Филарет (Дроздов) и несколько его сотоварищей были истребованы в Петербург.
Для призванных открылись большие возможности: по воле царя и священноначалия в столице Империи проводилось реформирование духовных учебных заведений ради повышения уровня образования.
Наиболее ярко смог проявить себя инок Филарет, в марте 1809 года посвященный в сан иеромонаха: он последовательно занимает должности преподавателя и инспектора Семинарии, преподавателя и ректора Духовной Академии.
С огромным напряжением трудится иеромонах Филарет. Ему необходимо читать учащимся курсы, по которым отсутствуют учебные пособия, поэтому приходится самому составлять их на основе святоотеческих трудов и с учетом развития европейской богословской мысли. Много времени отнимают административные обязанности, немало духовных сил уходит и на отстаивание чисто православного направления в обучении студентов Академии.
Небывало ярко в те годы вспыхивает талант Филарета-проповедника. Произнесенные им в Троицком соборе Александро-Невской лавры проповеди в праздник Пасхи и в день Пятидесятницы в 1811 году привлекли к будущему Святителю всеобщее внимание, а Слова на кончину графа Строганова и на погребение фельдмаршала Кутузова сделали его знаменитым.
