Менее чем через год после создания ЦРУ Советом национальной безопасности по инициативе вновь назначенного исполнительного секретаря этого органа С. У. Сауэрса (в недавнем прошлом занимавшего пост ДЦР) было принято решение о проверке работы управления, для чего создали комиссию в составе трех авторитетных нью-йоркских адвокатов Аллена Даллеса, Уильяма Джексона и Матьяса Корреа. Проверка проводилась по следующим аспектам: соответствие структуры организации поставленным задачам; результаты оперативной деятельности; проблемы межведомственного взаимодействия. В январе 1949 года отчет о проверке был готов и представлен на суд членов СНБ.
После обсуждения выводов комиссии СНБ наложил резолюцию, которая в целом весьма критически оценивала деятельность ЦРУ. В частности, был отмечен факт своеволия руководства управления, не всегда выполнявшего прямые указания руководства страны; зачастую самоустранение директора от непосредственного управления разведывательными операциями и, наконец, фактическое отсутствие отлаженных механизмов взаимодействия с другими спецслужбами. Там же еще раз подчеркивалось, что оптимальная координация работы национальных спецслужб может быть обеспечена только при гражданском директоре Центральной разведки [59, А-10].
В свою очередь и законодательная власть вознамерилась подвергнуть ЦРУ проверке, для чего в 1948 году Конгресс образовал свою комиссию во главе с бывшим президентом Гербертом Гувером, который под выполнение конкретной задачи образовал специальную группу проверки во главе с крупным бизнесменом Фердинандом Эберштадтом. Комиссия вскрыла целый ряд недостатков, которые якобы негативным образом продолжали сказываться на позитивной в целом работе управления. Так, например, в обнародованном в ноябре того же года докладе комиссии отмечались явные упущения по анализу научных достижений в иностранных государствах и, соответственно, отсутствие должным образом поставленной работы с постановкой задач в области научно-технической разведки. Данные акценты комиссии были вызваны главным образом опасением американских властей относительно возможных научных достижений у противника (СССР) в области создания ядерного оружия. В качестве предложения по устранению этих недостатков рекомендовалось значительно усилить координацию в работе спецслужб и активизировать проведение совместных разведывательных операций [59, А-11].
Параллельно законодательная власть страны продолжала работу по расширению функций ЦРУ. Так, в 1949 году Конгресс утвердил дополнительную нормативно-правовую базу, наделявшую директора Центральной разведки определенными полномочиями, необходимыми для проведения специальных операций, которых были лишены руководители других спецслужб. Более того, новыми законами ДРЦ позволялось личным решением использовать дополнительные денежные средства в целях оптимизации работы ЦРУ, не руководствуясь бюрократическими нормами и правилами, которые обычно тормозили выполнение тех или иных задач другими спецслужбами. Одним из новых законов ЦРУ разрешалось использовать дополнительные финансы из государственных фондов лишь на основе письменного решения ДРЦ.
