На первых порах в наиболее привилегированном положении оказалось Федеральное бюро расследований, директором которого еще до прихода в Белый дом Рузвельта был назначен Эдгар Гувер. Задачи ФБР значительно расширились, особенно в середине 30-х годов, в период резкого обострения обстановки в Европе и Тихоокеанском регионе и озабоченности американского военно-политического руководства вероятностью прямого вовлечения страны в надвигавшуюся мировую войну. В этот период на ФБР был возложен значительный объем задач, включавший контрразведывательную деятельность, борьбу с диверсиями, расследование антиконституционной деятельности в целом и нарушений законодательства о нейтралитете в частности.
Непосредственно реформированием разведывательной деятельности президент Рузвельт занялся в 1939 году, фактически накануне начала Второй мировой войны. 26 июня им была подписана, по сути, историческая директива, впервые формально разделившая разведывательные и контрразведывательные полномочия между федеральными ведомствами. В ведение ФБР попало все Западное полушарие, за исключением зоны Панамского канала. На военно-морское ведомство была возложена ответственность за Тихоокеанский регион. Военное ведомство стало отвечать за Европейский, Африканский регионы и зону Панамского канала. Все разведывательные органы получили право действовать на Гавайских островах, поскольку в этом районе особую активность проявляла Япония [2].
По поводу распределения контрразведывательных полномочий в директиве президента четко указывалось, что «расследования по фактам шпионажа, контршпионажа и саботажа осуществляются ФБР, управлением военной разведки Военного министерства и отделом военно-морской разведки Министерства ВМС» [2]. Далее подчеркивалась настоятельная необходимость жесткой координации усилий перечисленных органов в деле осуществления контрразведывательной деятельности.
Помимо указанных в директиве президента ведомств разведдеятельностью традиционно занимался и Государственный департамент, который на протяжении многих лет претендовал на особую роль в обеспечении руководства страны аналитически обработанной информацией. В период разработки президентской директивы Госдеп и некоторые члены аппарата президентской администрации при поддержке ряда законодателей выдвинули предложение о возложении координирующих функций в области разведки именно на внешнеполитическое ведомство страны. Однако президент не торопился с выбором координатора, оставив этот вопрос на дополнительную проработку.
